More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2161 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  72.15 
 
 		 509 aa  723    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3063  glucose-methanol-choline oxidoreductase  80.32 
 
 		 559 aa  881    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.924929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2161  choline dehydrogenase  100 
 
 		 588 aa  1177    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  71.01 
 
 		 545 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.2 
 
 		 536 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4412  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.57 
 
 		 509 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  36.1 
 
 		 574 aa  284  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.24 
 
 		 518 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.29 
 
 		 530 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  37.48 
 
 		 553 aa  268  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0553  choline dehydrogenase  37.64 
 
 		 566 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  35.29 
 
 		 560 aa  266  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5100  choline dehydrogenase  37.08 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5182  choline dehydrogenase  37.08 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3268  choline dehydrogenase  37.08 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.52 
 
 		 516 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5064  choline dehydrogenase  37.01 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5037  choline dehydrogenase  36.89 
 
 		 566 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  34.33 
 
 		 560 aa  259  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  35.5 
 
 		 561 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0401  choline dehydrogenase  37.15 
 
 		 563 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.726855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4512  choline dehydrogenase  36.7 
 
 		 566 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  35.86 
 
 		 553 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0728  choline dehydrogenase  35.59 
 
 		 566 aa  257  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1515  choline dehydrogenase  36.53 
 
 		 555 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.307618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2554  choline dehydrogenase  35.66 
 
 		 559 aa  256  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102453  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3536  choline dehydrogenase  36.52 
 
 		 566 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5115  choline dehydrogenase  36.57 
 
 		 565 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  35.88 
 
 		 561 aa  256  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4937  choline dehydrogenase  36.64 
 
 		 565 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  34.92 
 
 		 564 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.76 
 
 		 551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4867  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.27 
 
 		 560 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3310  choline dehydrogenase  36.33 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  35.73 
 
 		 565 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3295  choline dehydrogenase  34.46 
 
 		 556 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0914  choline dehydrogenase  36.33 
 
 		 565 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267909  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0326  choline dehydrogenase  34.46 
 
 		 556 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.77 
 
 		 539 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0179  choline dehydrogenase  36.33 
 
 		 565 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  34.27 
 
 		 562 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  34.46 
 
 		 556 aa  254  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  34.46 
 
 		 556 aa  254  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0468  choline dehydrogenase  36.33 
 
 		 565 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1428  choline dehydrogenase  36.33 
 
 		 565 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.783226  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6326  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.21 
 
 		 554 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.79 
 
 		 534 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00267  choline dehydrogenase  34.46 
 
 		 556 aa  253  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00270  hypothetical protein  34.46 
 
 		 556 aa  253  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0377  choline dehydrogenase  36.33 
 
 		 565 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119078  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  36.26 
 
 		 572 aa  253  6e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1925  choline dehydrogenase  36.33 
 
 		 565 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0217321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1837  choline dehydrogenase  36.33 
 
 		 565 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1072  choline dehydrogenase  36.52 
 
 		 565 aa  253  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5244  choline dehydrogenase  36.19 
 
 		 567 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80037  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0342  choline dehydrogenase  34.27 
 
 		 562 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0130  choline dehydrogenase  35.08 
 
 		 547 aa  252  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105235  normal  0.777409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  35.16 
 
 		 565 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2727  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.35 
 
 		 525 aa  252  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  34.47 
 
 		 561 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0443  choline dehydrogenase  36.09 
 
 		 568 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  34.47 
 
 		 561 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  34.47 
 
 		 561 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70940  choline dehydrogenase  36.14 
 
 		 561 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  34.47 
 
 		 561 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  35.11 
 
 		 560 aa  250  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  35.9 
 
 		 568 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.27 
 
 		 551 aa  250  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5058  choline dehydrogenase  36.72 
 
 		 561 aa  250  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0575159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  34.08 
 
 		 539 aa  249  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0481  choline dehydrogenase  35.46 
 
 		 565 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.44 
 
 		 551 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2917  choline dehydrogenase  35.7 
 
 		 567 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80885  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.69 
 
 		 550 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2831  choline dehydrogenase  35.7 
 
 		 567 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6157  choline dehydrogenase  35.96 
 
 		 561 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.35 
 
 		 544 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0874  choline dehydrogenase  34.72 
 
 		 565 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5834  choline dehydrogenase  35.61 
 
 		 577 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1710  choline dehydrogenase  35.7 
 
 		 561 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  35.66 
 
 		 570 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.71 
 
 		 574 aa  247  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1592  choline dehydrogenase  36.16 
 
 		 561 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.860333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.74 
 
 		 529 aa  246  9e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2176  choline dehydrogenase  33.52 
 
 		 572 aa  246  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  34.22 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  35.87 
 
 		 556 aa  245  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6705  choline dehydrogenase  37.5 
 
 		 516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.81 
 
 		 554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8399  choline dehydrogenase  36.38 
 
 		 574 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553301  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  33.52 
 
 		 562 aa  244  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.52 
 
 		 551 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.33 
 
 		 576 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.56 
 
 		 515 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1832  choline dehydrogenase  35.42 
 
 		 560 aa  243  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.287087  normal  0.448798 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1492  choline dehydrogenase  34.35 
 
 		 556 aa  243  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  35.15 
 
 		 541 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  34.09 
 
 		 556 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  36.14 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>