More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1175 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 310 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  63.91 
 
 		 310 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  52.85 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  48.68 
 
 		 318 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  48.38 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  42.2 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  40.98 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  40.94 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.46 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  35.1 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  37.42 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  36.09 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  35.33 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  35.87 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 		 359 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 319 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  33.12 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.67 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  36.51 
 
 		 325 aa  158  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  35.12 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  35.88 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  33.11 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 297 aa  149  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 320 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 214 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  35.95 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.96 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  33.57 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  31.53 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.67 
 
 		 329 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  31.99 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  32.56 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  29.71 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  31.02 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>