127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0258 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  100 
 
 
326 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  58.05 
 
 
326 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  56.4 
 
 
325 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  57.14 
 
 
326 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  49.7 
 
 
339 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  48.79 
 
 
330 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  52.05 
 
 
297 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  47.15 
 
 
330 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  41.99 
 
 
338 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  43.87 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  41.54 
 
 
331 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  43.64 
 
 
336 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  37.42 
 
 
317 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  35.94 
 
 
358 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  32.95 
 
 
326 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  34.55 
 
 
319 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  32.27 
 
 
351 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  32.45 
 
 
331 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  35.59 
 
 
340 aa  156  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  30.72 
 
 
339 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  29.77 
 
 
336 aa  149  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  29.77 
 
 
336 aa  149  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  29.02 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
336 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  28.22 
 
 
316 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  29.76 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24.43 
 
 
345 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  25.99 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  27.4 
 
 
364 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.99 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.13 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.67 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.67 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  26.96 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.4 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.74 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.97 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.23 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  25.81 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  26.87 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  25.58 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  22.92 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  27.13 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  26.72 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.71 
 
 
629 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  23.33 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.55 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  25 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  27.86 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
358 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  30.64 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.3 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.03 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.21 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  23.67 
 
 
341 aa  63.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
361 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
366 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.24 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  24.71 
 
 
336 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.16 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  24.32 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  27.87 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  24.09 
 
 
395 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  24.47 
 
 
381 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  24.71 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  24.76 
 
 
387 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  22.97 
 
 
363 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  23.81 
 
 
276 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  24.46 
 
 
402 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  25 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
432 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
432 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
432 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.2 
 
 
351 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  39.29 
 
 
331 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.52 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  23.44 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  24.75 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.33 
 
 
393 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  21.9 
 
 
391 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  25.47 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>