234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3958 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
308 aa  603  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  52.05 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  53.22 
 
 
299 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  46.37 
 
 
321 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  39.19 
 
 
298 aa  192  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  40 
 
 
297 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  42.18 
 
 
358 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  40.87 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  40.87 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  40.87 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  33.9 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  34.07 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  30.82 
 
 
315 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  30.82 
 
 
315 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  30.82 
 
 
315 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  30.81 
 
 
303 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.35 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.47 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  30.32 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  30.1 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  28.44 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0713  hypothetical protein  28.33 
 
 
313 aa  89  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.689852 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.1 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  30.56 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.3 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
322 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.19 
 
 
294 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  30.69 
 
 
317 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.33 
 
 
353 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.59 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  27.76 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.3 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  22.86 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  27.06 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  24.2 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.47 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.26 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  27.31 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  26.67 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  30 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25.37 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.27 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  29.21 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  28 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  27.92 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  28.66 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  28.79 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  34.29 
 
 
431 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.27 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  28.08 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  27.99 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.03 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  27.62 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.52 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  27.3 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  26.41 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1988  hypothetical protein  29.62 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.46 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  32.14 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  28.23 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  26.41 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  24.54 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  27.3 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  28.81 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  22.18 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.73 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.24 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  27.48 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  27.21 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.83 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  30.51 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.56 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.17 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  30.96 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  25.35 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  22.53 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  28.29 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  25.83 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.7 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.81 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.35 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  24.75 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.24 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  29.63 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  27.92 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
434 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  31.68 
 
 
440 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  26.86 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  28.57 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  28.11 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  25.84 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  27.14 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  26.26 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  28.06 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  31.75 
 
 
432 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.87 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>