More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3687 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 321 aa  624  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  68 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  58.76 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  55.67 
 
 		 344 aa  308  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  59.11 
 
 		 302 aa  295  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  56.33 
 
 		 330 aa  292  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  56.68 
 
 		 333 aa  292  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  48.5 
 
 		 365 aa  278  6e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  40.85 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  42.42 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  39.08 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  37.69 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  36.93 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  38.81 
 
 		 312 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  34.34 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  37.82 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34.66 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  36.14 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  36.05 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  37.16 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  43.42 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  35.57 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  37.27 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  37.79 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  32.03 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  35.79 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  33.91 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  39.62 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  37.02 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  34.9 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  37.55 
 
 		 305 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  42.24 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  31.67 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  37.85 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  28.8 
 
 		 363 aa  122  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  30.23 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  23.93 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  22.15 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  26.87 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  29.48 
 
 		 460 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  26.72 
 
 		 392 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  26.06 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  24.82 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  25.96 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  24.67 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  25.69 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  26.64 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  26.46 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  23.57 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.51 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  26.3 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  27.17 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  27.17 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  27.17 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  27.17 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  27.17 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  27.17 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  27.17 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  27.17 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  24.58 
 
 		 422 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  25.95 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  24.29 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  25.99 
 
 		 459 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  24.28 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  24.28 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 401 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>