More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3172 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 279 aa  538  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  69.5 
 
 		 285 aa  347  8e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  63.6 
 
 		 281 aa  328  8e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  65.13 
 
 		 285 aa  317  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  57.41 
 
 		 278 aa  275  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  47.57 
 
 		 280 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  47.25 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  43.66 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  44.4 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  51.54 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  44.77 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  43.73 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  45.83 
 
 		 284 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  38.83 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.47 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  38.95 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  33.95 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30.83 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  34.25 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  33.85 
 
 		 261 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 366 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  33.51 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.87 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  28.65 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.19 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  27.33 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  29.69 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  27.95 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.49 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  27.73 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.67 
 
 		 384 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 390 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  30.95 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.91 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.82 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  27.27 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  33.99 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  24.5 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  28 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  25.24 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  28.63 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  27.32 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  24.02 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  26.6 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  25.15 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  22.5 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>