More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2829 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 517 aa  1018    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  68.52 
 
 		 492 aa  644    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  67.91 
 
 		 492 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  68.61 
 
 		 484 aa  640    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  71.31 
 
 		 493 aa  662    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  59.22 
 
 		 500 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  56.29 
 
 		 489 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  55.6 
 
 		 490 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  51.33 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  48.71 
 
 		 521 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  50.31 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  50.42 
 
 		 491 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 		 497 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  49.69 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 508 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  49.37 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  47.91 
 
 		 516 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  43.83 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 512 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 		 494 aa  365  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  43.74 
 
 		 500 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 511 aa  356  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 501 aa  356  6.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 		 520 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 500 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 		 502 aa  349  6e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 		 496 aa  346  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  43.21 
 
 		 501 aa  329  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  44.56 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 		 475 aa  249  6e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 		 470 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  23.19 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 647 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 636 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 613 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 215 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.06 
 
 		 895 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 1390 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 875 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 874 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 3706 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 551 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 382 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 767 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 368 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 856 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 991 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 347 aa  92.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 662 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 878 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 362 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 657 aa  91.3  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 570 aa  91.3  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 363 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 572 aa  90.9  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 924 aa  90.5  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 532 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 1227 aa  89.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 360 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  39.32 
 
 		 366 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 366 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 2693 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 362 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 362 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 864 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 381 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 294 aa  87  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.22 
 
 		 348 aa  87  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 416 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 666 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 871 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1210 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  27.76 
 
 		 754 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.17 
 
 		 1239 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.7 
 
 		 744 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 348 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.48 
 
 		 381 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 348 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 366 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 815 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 839 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 1714 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>