297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4410 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  94.82 
 
 		 471 aa  844    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  86.59 
 
 		 441 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  85.16 
 
 		 437 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  81.18 
 
 		 460 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 469 aa  936    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  85.16 
 
 		 437 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  85.62 
 
 		 437 aa  735    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  68.17 
 
 		 445 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  67.95 
 
 		 445 aa  571  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  61.87 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  62.44 
 
 		 436 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  59.08 
 
 		 437 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  58.77 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  57.41 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  57.92 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  58.9 
 
 		 440 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  56.63 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  53.01 
 
 		 439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  55.61 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  51.01 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  51.33 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  57.51 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  50.34 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  50.9 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  49.89 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  55.66 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  50.79 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  54.65 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  50.34 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  55.89 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  50.11 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  52.79 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  54.02 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  46.98 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  45.49 
 
 		 475 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  47.59 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  50.25 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  48.8 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  53.99 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  45.82 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  49.75 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  45.35 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  47.12 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  44.86 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  47.86 
 
 		 421 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  40.88 
 
 		 484 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  37.96 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.33 
 
 		 1041 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  36.63 
 
 		 416 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.69 
 
 		 1263 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.32 
 
 		 863 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  37.21 
 
 		 508 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.29 
 
 		 937 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  32.95 
 
 		 1015 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  30.99 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.29 
 
 		 937 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  29.89 
 
 		 892 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.69 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.57 
 
 		 1107 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.12 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30.21 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  30.69 
 
 		 757 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  28.95 
 
 		 886 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.89 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.4 
 
 		 867 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  34.03 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  36.26 
 
 		 761 aa  67.8  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  30.06 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 		 627 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  24.85 
 
 		 925 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.15 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  32.09 
 
 		 1024 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.4 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 612 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.17 
 
 		 1749 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38832  predicted protein  29.07 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00223865  hitchhiker  0.00603177 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.87 
 
 		 972 aa  60.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  27.81 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  32.41 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04290  protein kinase, putative  27.96 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0054946  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57744  predicted protein  23.41 
 
 		 893 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151304  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  30.58 
 
 		 980 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  30.58 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  32.32 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 721 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  30.54 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  27.38 
 
 		 1017 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51279  predicted protein  29.56 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  19.57 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21961  predicted protein  28.17 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  33.62 
 
 		 149 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  26.51 
 
 		 791 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  33.13 
 
 		 963 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1498 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  32.39 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1404  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 		 716 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  28.28 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>