More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1091 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  97.67 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  95.33 
 
 		 257 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  95.72 
 
 		 257 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  95.72 
 
 		 257 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  95.33 
 
 		 257 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  90.27 
 
 		 257 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  81.18 
 
 		 259 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  80.78 
 
 		 256 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  80.39 
 
 		 256 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  80.39 
 
 		 256 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  80.39 
 
 		 256 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  80.39 
 
 		 256 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  80.39 
 
 		 256 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  80 
 
 		 256 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  64.44 
 
 		 357 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  63.11 
 
 		 369 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  63.03 
 
 		 361 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  61.76 
 
 		 369 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  62.61 
 
 		 353 aa  298  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  62.18 
 
 		 347 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3701  ABC transporter related  66.06 
 
 		 228 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  60.92 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  60.41 
 
 		 359 aa  294  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  60.5 
 
 		 369 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  59.24 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  60.5 
 
 		 369 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  60.5 
 
 		 369 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  63.93 
 
 		 357 aa  292  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  59.18 
 
 		 355 aa  292  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  61.76 
 
 		 386 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  62.5 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  61.48 
 
 		 354 aa  288  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  61.34 
 
 		 369 aa  287  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  60.5 
 
 		 368 aa  284  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  61.34 
 
 		 365 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  59.59 
 
 		 358 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  59.59 
 
 		 358 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  59.76 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  56.18 
 
 		 405 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 		 356 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  58.82 
 
 		 375 aa  277  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  62.11 
 
 		 376 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  62.96 
 
 		 371 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  60.17 
 
 		 355 aa  275  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  59.24 
 
 		 361 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  56.72 
 
 		 348 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  58.87 
 
 		 415 aa  263  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  62.18 
 
 		 360 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  62.18 
 
 		 360 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  55.46 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  59.92 
 
 		 389 aa  258  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  59.34 
 
 		 372 aa  256  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2991  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1344  ABC transporter related  57.8 
 
 		 227 aa  254  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.274567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  55.74 
 
 		 390 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  57.4 
 
 		 378 aa  251  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  51.48 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  50.21 
 
 		 343 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  52.32 
 
 		 355 aa  244  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 		 350 aa  241  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  52.05 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  54.44 
 
 		 368 aa  238  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  50.88 
 
 		 342 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  48.33 
 
 		 342 aa  238  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 		 349 aa  238  9e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  51.08 
 
 		 342 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  52.02 
 
 		 349 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  52.47 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  52.81 
 
 		 357 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  56.89 
 
 		 346 aa  234  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  55 
 
 		 371 aa  234  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.21 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  56.7 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  47.92 
 
 		 343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  51.57 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.59 
 
 		 377 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.59 
 
 		 377 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.59 
 
 		 377 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  50.22 
 
 		 349 aa  231  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  48.02 
 
 		 348 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  54.39 
 
 		 355 aa  231  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  51.12 
 
 		 349 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 		 377 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  49.21 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.36 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  53.33 
 
 		 363 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  49.21 
 
 		 366 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  52.16 
 
 		 352 aa  229  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 		 377 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 		 377 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 		 377 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  51.46 
 
 		 377 aa  229  4e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  52.42 
 
 		 388 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>