168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2539 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  93.15 
 
 
335 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  93.15 
 
 
335 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  93.15 
 
 
335 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  85.71 
 
 
306 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  85.71 
 
 
306 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  85.71 
 
 
306 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  64.29 
 
 
326 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  64.29 
 
 
326 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  64.29 
 
 
326 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  61.01 
 
 
330 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  62.1 
 
 
322 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  58.41 
 
 
330 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  63.69 
 
 
326 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  58.93 
 
 
342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  56.85 
 
 
359 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  52.08 
 
 
241 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  46.01 
 
 
312 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  38.81 
 
 
308 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  38.81 
 
 
308 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  45.8 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  44.17 
 
 
308 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  45.16 
 
 
318 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  40.59 
 
 
320 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  37.97 
 
 
293 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  35.68 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  34.78 
 
 
313 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  34.78 
 
 
313 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  33.99 
 
 
294 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  34.36 
 
 
293 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  35.91 
 
 
303 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  31.76 
 
 
294 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  33.97 
 
 
294 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  32.96 
 
 
293 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  28.84 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  31.76 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  24.7 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  29.04 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  30.32 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  28.12 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  25.15 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  27.98 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.34 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  25.62 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  28.57 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  28.02 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  24.32 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  27.45 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  27.45 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  26.96 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  27.46 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  26.78 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  27.27 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  26.02 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  26.77 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.63 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  29.29 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.78 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  27.81 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  26.99 
 
 
660 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  27.33 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  26.34 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  26.32 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  26.09 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  24.65 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  23.94 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  24.51 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  26.63 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  27.8 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  26.63 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  26.63 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.61 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  22.73 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  26.47 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0073  type II secretion system protein  23.21 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  24.61 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  27.06 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.18 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  24.32 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  23.91 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  24.47 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  25 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  27.17 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03348  Flp pilus assembly protein TadB  21.08 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  26.89 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  25.21 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  23.91 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  26.2 
 
 
325 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25.65 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  26.78 
 
 
329 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  27.87 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25.61 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  24.12 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  28.66 
 
 
310 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  22.34 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  23.78 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  24.62 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  26.88 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  23.38 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  23.78 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>