More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1777 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  100 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  99.34 
 
 		 304 aa  599  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  87.5 
 
 		 304 aa  504  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3429  farnesyl-diphosphate synthase  71.48 
 
 		 305 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  67.34 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  57.72 
 
 		 300 aa  332  6e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3829  Polyprenyl synthetase  67.68 
 
 		 304 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4157  Polyprenyl synthetase  67.34 
 
 		 304 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4337  geranyltranstransferase  70.21 
 
 		 283 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  55.15 
 
 		 308 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  54.15 
 
 		 307 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  55.48 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  53.49 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  54.79 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  53.33 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  54.67 
 
 		 308 aa  299  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  55.3 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  52.65 
 
 		 337 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  59.71 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  54.3 
 
 		 309 aa  275  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  56.45 
 
 		 290 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  54.15 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  54.15 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  51.87 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  53.64 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  55.15 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  46.58 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  56.44 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  42.07 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  47.29 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  44.52 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  44.52 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  47.21 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  49.12 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  46.21 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  42.81 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  47.17 
 
 		 293 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  48.68 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  48.87 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  47.83 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  44.88 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  46.01 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  45.85 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  45.85 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  45.85 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  44.74 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  45.85 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  51.69 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  42 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  42.23 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  42 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  45.63 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  46.21 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  46.59 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  41.31 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  45 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  41.55 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  42.91 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  45.49 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  39.67 
 
 		 316 aa  215  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  40.66 
 
 		 290 aa  215  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  41.22 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  47.8 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  46.32 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  48.01 
 
 		 293 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  39.8 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  41.79 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  39.87 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  48.87 
 
 		 291 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  43.29 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  40.54 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  41.53 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  43.49 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  45.72 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  47.65 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  40.54 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  41.48 
 
 		 312 aa  208  9e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  46.79 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  48.84 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  48.44 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  46.75 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  45.78 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  44.7 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  47.91 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  40.94 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  41.28 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.53 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  45.69 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  46.24 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  40.2 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  44.85 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 		 285 aa  205  9e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  44 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0399  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  41.73 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2796  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>