More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1484 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1484  NagC family Transcriptional regulator  100 
 
 		 402 aa  821    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.511985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  34.28 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2213  ROK family protein  32.11 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.915289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2815  ROK family protein  32.82 
 
 		 389 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231049  normal  0.37172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  31.62 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31570  transcriptional regulator/sugar kinase  31.54 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.556832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  28.38 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  27.34 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  28.68 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  27.23 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  26.5 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.03 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  26.58 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.8 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.43 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  26.84 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.88 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  24.93 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  26.32 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  24.16 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  26.18 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  26.37 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  27.51 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  21.16 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  25.86 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4946  ROK family protein  25.93 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  22.38 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  23.62 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.17 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  22.56 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  23.6 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  24.4 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  23.44 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  25.13 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  22.87 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  22.87 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  22.87 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  22.87 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  22.87 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  22.87 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  22.87 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  22.87 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  22.87 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  21.89 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  22.74 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  20.64 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  22.94 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  23.38 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  26.15 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  24.07 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  20.81 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  24.46 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.85 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  21.43 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  22.44 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  21.75 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  21.7 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  21.7 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  21.75 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  21.7 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  21.7 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  21.75 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  21.75 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  21.7 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  21.75 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  21.75 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  20.59 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  21.75 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  21.75 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  21.7 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  21.75 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  20.59 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  29.63 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  20.59 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  26.65 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  25.07 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  27.61 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  21.73 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  25.19 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  22.86 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.18 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  20.74 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.14 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  23.53 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  21.69 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  20.74 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  25.76 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  30.15 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  22.92 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  24.72 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  24.24 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  30.58 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  22.01 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  26.61 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  29 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  24.54 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  22.4 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  20.98 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  24.23 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>