282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6138 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6138  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0272173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1730  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262216  normal  0.802647 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.65 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1512  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  32.83 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2790  OmpA/MotB domain-containing protein  31.48 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0017  OmpA/MotB domain protein  53.85 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  40 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  32.95 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  34.34 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.87 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  34.62 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  35.45 
 
 		 220 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 		 514 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 534 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 623 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  30.64 
 
 		 388 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  34.12 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  44.16 
 
 		 756 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  34.58 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  38 
 
 		 648 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  28.07 
 
 		 456 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  34.34 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  33.98 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  32.41 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.15 
 
 		 707 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  35.63 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.08 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.96 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  40.45 
 
 		 178 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  35.9 
 
 		 193 aa  49.3  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  48.89 
 
 		 166 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  31.9 
 
 		 322 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  31.15 
 
 		 168 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 		 168 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  31.15 
 
 		 168 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.37 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  35.63 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  35.06 
 
 		 656 aa  49.3  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  31.39 
 
 		 533 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  25.56 
 
 		 447 aa  48.9  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  36.78 
 
 		 311 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0311  outer membrane protein, OmpA family  43.1 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  31.46 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  38.82 
 
 		 727 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  36.78 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.29 
 
 		 402 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  35.63 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  45.9 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  32.32 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 434 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  40.32 
 
 		 640 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  40.32 
 
 		 424 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  46.67 
 
 		 510 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  35.63 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  35.63 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.33 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  30.88 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  32.14 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  42.86 
 
 		 630 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  35.63 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  35.63 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  48.15 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.94 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  31.63 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03342  hypothetical protein  28.15 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  37.1 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  30.39 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  30.33 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  42.31 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  30 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  37.08 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.06 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  39.44 
 
 		 350 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.94 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  28.36 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  32.71 
 
 		 168 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  34.55 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  34.55 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  34.55 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>