More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0311 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0311  outer membrane protein, OmpA family  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02232  hypothetical protein  55 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003529  outer membrane protein  57.6 
 
 		 272 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.25 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  30.95 
 
 		 1026 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  32.11 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  34.69 
 
 		 333 aa  67  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  30.15 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  37.25 
 
 		 415 aa  65.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  31.19 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  29.36 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  33.02 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 		 224 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.93 
 
 		 176 aa  62  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  33 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  27.97 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  34.86 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  28.47 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  30.82 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  31.48 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09021  putative outer membrane protein  35.71 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  32.08 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  32.67 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  29.81 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  30.84 
 
 		 673 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  32.65 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  32.38 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  32.67 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  28.7 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  28.57 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  36.08 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  30.39 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  28.57 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  27.97 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  32.11 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1435  OmpA/MotB domain-containing protein  33.67 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.83553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  29.46 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  31.19 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.71 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.1 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  34.55 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  32.41 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  29.52 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  29.57 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  30.56 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  30.69 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  38.27 
 
 		 620 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  30.63 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  29.63 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  30.39 
 
 		 216 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  29.25 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  29.25 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.63 
 
 		 656 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  30.19 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.25 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  30.19 
 
 		 226 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  29.91 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  32.46 
 
 		 648 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  32.32 
 
 		 433 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.11 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  28.7 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  30.97 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  27.62 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  30.97 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1730  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262216  normal  0.802647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>