More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03342 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03342  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  38.74 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 166 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  32.68 
 
 		 319 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 335 aa  87  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  32.47 
 
 		 319 aa  86.7  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  42.42 
 
 		 328 aa  86.3  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43 
 
 		 337 aa  85.9  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  43.12 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  42 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  32.47 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.53 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0923  Omp18  38.17 
 
 		 168 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.540473  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  34.56 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1744  Omp18  34.48 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00216303  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  40.95 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  39.81 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  39.81 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  39.81 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  39.81 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  39.81 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  39.81 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 403 aa  78.2  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  39.81 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.62 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  40 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0108  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  38.24 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0120  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  37.5 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000178354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.38 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0148  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  38.24 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125516  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  32.86 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  39.81 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.89 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.38 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  37.19 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  39.05 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3482  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.784899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.48 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3418  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.88 
 
 		 623 aa  75.9  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.2 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  32.62 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  39.62 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2085  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.38 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000014342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  41.41 
 
 		 429 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  38.02 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  36.44 
 
 		 481 aa  75.5  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  37.84 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  34.38 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0201  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  36.54 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000039239  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  43.27 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.96 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  41.75 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  37.27 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  43.42 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  43.04 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  34.29 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.83 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  39.39 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.51 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>