243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2774 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  100 
 
 		 376 aa  750    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  43.38 
 
 		 373 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  43.38 
 
 		 374 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  43.1 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  43.7 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  45.51 
 
 		 386 aa  295  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  41.76 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  41.57 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  41.57 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  43.1 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  40.68 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  47.62 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  37.61 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  32.35 
 
 		 275 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  36.87 
 
 		 295 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  35.09 
 
 		 282 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  35.48 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  36.94 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.98 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  34.81 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  32.9 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  32.39 
 
 		 304 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  32.39 
 
 		 304 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  32.9 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  32.9 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  33.33 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  36.54 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  30.64 
 
 		 328 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  33.11 
 
 		 218 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  33.11 
 
 		 218 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  33.55 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  33.55 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.78 
 
 		 293 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  32.18 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.84 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  33.55 
 
 		 304 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  33.33 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  35.71 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  33.77 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  35.06 
 
 		 304 aa  93.6  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  35.26 
 
 		 287 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  35.1 
 
 		 302 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  30.59 
 
 		 295 aa  92.8  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  35.06 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  30.48 
 
 		 297 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  35.26 
 
 		 287 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  35.26 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  35.44 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  33.54 
 
 		 292 aa  91.3  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  32.1 
 
 		 270 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  29.67 
 
 		 256 aa  90.5  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  33.97 
 
 		 288 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  33.52 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32.89 
 
 		 267 aa  89.7  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  33.33 
 
 		 288 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  32 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  33.33 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  33.33 
 
 		 288 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  32.76 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  29.91 
 
 		 272 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  28.85 
 
 		 274 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 284 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  32.28 
 
 		 285 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  33.97 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  27.91 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  27.91 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  31.29 
 
 		 273 aa  86.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  32.5 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  34.72 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  35.81 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  34.73 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  32.28 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  28.11 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.72 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  33.11 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  32.88 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  34.25 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  31.47 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  33.77 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  31.28 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  35.66 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  33.54 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  31.48 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  32.21 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  31.76 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  32.57 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.69 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  25.4 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  30.89 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  30.11 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  32.53 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  30.34 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.74 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.29 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  29.12 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  31.79 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  32.21 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  31.25 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  28.73 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>