220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0982 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0982  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  287  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 454 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 		 398 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1483  signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 391 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  44.86 
 
 		 1165 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  43.93 
 
 		 1170 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5369  hypothetical protein  38.71 
 
 		 271 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 334 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 341 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 631 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  42.06 
 
 		 1170 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  45.1 
 
 		 1027 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 713 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  37.41 
 
 		 717 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  39.42 
 
 		 505 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3819  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 318 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 481 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 713 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 677 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 488 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 738 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 338 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 559 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  38.46 
 
 		 847 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 258 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  38.46 
 
 		 847 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 577 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 840 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  44.86 
 
 		 855 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  42.99 
 
 		 849 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 489 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  44.25 
 
 		 872 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.71 
 
 		 847 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  47.96 
 
 		 856 aa  84.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  45.26 
 
 		 460 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 553 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  36.8 
 
 		 499 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  41.11 
 
 		 822 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 930 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 		 929 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 662 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  43.1 
 
 		 844 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3818  signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.883776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 488 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  37.84 
 
 		 844 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 588 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  39.01 
 
 		 852 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 339 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  33.33 
 
 		 261 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  45.68 
 
 		 842 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  53.09 
 
 		 347 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 333 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7680  hypothetical protein  33.86 
 
 		 320 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 491 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  37.5 
 
 		 930 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 430 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  38.4 
 
 		 463 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  38.4 
 
 		 463 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 850 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 352 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 514 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.87 
 
 		 846 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 512 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  39.8 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 571 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 639 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 603 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 380 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 507 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 934 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 907 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 856 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  35.43 
 
 		 332 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4781  signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 356 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 602 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 601 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 		 901 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 263 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 488 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  32.14 
 
 		 488 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 1160 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 384 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 583 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 550 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  33.08 
 
 		 583 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 583 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 		 498 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  42.31 
 
 		 1167 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 1191 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  42.16 
 
 		 703 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 579 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  41.18 
 
 		 364 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 372 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2768  signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>