285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3883 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  100 
 
 
202 aa  413  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  75 
 
 
227 aa  322  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  73 
 
 
221 aa  305  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  69.65 
 
 
213 aa  297  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  66.34 
 
 
239 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  66.34 
 
 
239 aa  284  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  64.73 
 
 
230 aa  271  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  63.82 
 
 
233 aa  260  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  60 
 
 
253 aa  208  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  53.09 
 
 
232 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  52.17 
 
 
186 aa  191  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  46.19 
 
 
244 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  49.74 
 
 
229 aa  188  5e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  45.69 
 
 
239 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  44.27 
 
 
235 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  46.6 
 
 
224 aa  174  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  48.22 
 
 
211 aa  167  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  41.96 
 
 
238 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  41.46 
 
 
228 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  45.95 
 
 
231 aa  165  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  52.26 
 
 
157 aa  162  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  42.01 
 
 
244 aa  162  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  48.11 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  46 
 
 
207 aa  161  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  46.49 
 
 
240 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  46.6 
 
 
221 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  44.79 
 
 
214 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  53.09 
 
 
245 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  49.43 
 
 
221 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  50 
 
 
227 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  43.68 
 
 
232 aa  154  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 
231 aa  151  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  51.35 
 
 
213 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  41.44 
 
 
233 aa  147  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  48.08 
 
 
365 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  48.08 
 
 
365 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  36.6 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  47.02 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  47.44 
 
 
365 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 
383 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  47.06 
 
 
167 aa  143  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  44.13 
 
 
216 aa  141  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  43.85 
 
 
212 aa  141  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 
213 aa  141  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  45.51 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  37.85 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  42.08 
 
 
228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  37.08 
 
 
216 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  40.32 
 
 
492 aa  138  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 
267 aa  138  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  40.3 
 
 
228 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  42.21 
 
 
221 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  40.59 
 
 
251 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  51.08 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  43.02 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  37.7 
 
 
243 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  44.58 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  43.24 
 
 
235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 
267 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  43.1 
 
 
535 aa  135  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  46.82 
 
 
240 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  39.04 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  40.65 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  38.71 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 
244 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  44.44 
 
 
236 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  42.46 
 
 
247 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  37.02 
 
 
243 aa  131  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  44.32 
 
 
235 aa  131  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  40.3 
 
 
262 aa  131  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  43.56 
 
 
212 aa  131  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  45.66 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  44.89 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  45.14 
 
 
277 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  39.66 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  37.91 
 
 
246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  42.35 
 
 
246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  49.64 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  40 
 
 
234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  40.29 
 
 
234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 
251 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  39.46 
 
 
255 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  42.7 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  37 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  41.81 
 
 
222 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  42.31 
 
 
236 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  43.45 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 
238 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 
238 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 
238 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  38.97 
 
 
225 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  43.02 
 
 
213 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 
237 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  37.81 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  42.94 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>