271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3331 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  85.71 
 
 		 412 aa  733    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  100 
 
 		 412 aa  848    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  72.17 
 
 		 428 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  69.63 
 
 		 427 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  69.95 
 
 		 428 aa  607  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  69.7 
 
 		 428 aa  607  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  70.94 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  39.07 
 
 		 418 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  39.52 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  38.3 
 
 		 417 aa  279  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  38.69 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  36.17 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  36.65 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  36.34 
 
 		 415 aa  253  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  36.48 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  28.71 
 
 		 420 aa  169  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  26.74 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  29.18 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  27.76 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.78 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  27.65 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  27.41 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.56 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  25.95 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  27.72 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.08 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.5 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  25.5 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.82 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  28.3 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  28.08 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  25.67 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  24.79 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  27.06 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  25.82 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  24.75 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.46 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  27.7 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.55 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.99 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  26.35 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  24.92 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  26.35 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.55 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  27.97 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.57 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.78 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  26.05 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  26.35 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.14 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.16 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  25.15 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  24.38 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  25.88 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  30 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  24.46 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  30.18 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  27.21 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  25.71 
 
 		 515 aa  73.2  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  25.87 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  24.41 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  28.01 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  27.21 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  26.41 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.07 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  24.08 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  23.65 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  26.3 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  24.47 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  25 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  27.11 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  25.85 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  24.58 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  24.58 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  23.91 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  25 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  25 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  25 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  25.84 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  24.07 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  23.57 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  23.57 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  25 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  25.61 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  21.98 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  25 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  23.91 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  25.61 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  23.73 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  25.36 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  24.06 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  27.47 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  25.17 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  24.65 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  20.63 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  20.63 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.33 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  24.92 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  25.61 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>