88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1613 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1613  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 312 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0532  putative circadian clock protein, KaiC  47.55 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0701  putative circadian clock protein, KaiC  48.04 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  49.09 
 
 		 285 aa  288  6e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1463  putative circadian clock protein, KaiC  46.84 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0072  putative circadian clock protein, KaiC  48.29 
 
 		 295 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1964  putative circadian clock protein, KaiC  44.09 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  25.74 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  25.74 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  26.99 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  25.55 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  23.6 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  24.54 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  22.3 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  28.51 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  25.18 
 
 		 575 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  24.3 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  24.44 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  25.42 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  25.19 
 
 		 562 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  25.46 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  24.89 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  25.33 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  27.42 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  26.34 
 
 		 514 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  25.62 
 
 		 569 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  24.9 
 
 		 519 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  24.72 
 
 		 567 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  27.42 
 
 		 512 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  23.18 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  23.72 
 
 		 574 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  25.7 
 
 		 512 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  23.18 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  30.57 
 
 		 509 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  26.01 
 
 		 519 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  23.68 
 
 		 570 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  23.27 
 
 		 570 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  22.52 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  25.54 
 
 		 512 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  25.93 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  25.27 
 
 		 500 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  28.88 
 
 		 500 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  23.71 
 
 		 575 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  29.41 
 
 		 509 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  24.69 
 
 		 519 aa  52.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  28.88 
 
 		 498 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  24.53 
 
 		 562 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  28.88 
 
 		 509 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  26.69 
 
 		 461 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  29.03 
 
 		 520 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  22.76 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  29.03 
 
 		 528 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  27.63 
 
 		 224 aa  49.3  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  24.16 
 
 		 560 aa  49.3  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  25.94 
 
 		 550 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  22.91 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  24.26 
 
 		 559 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  23.05 
 
 		 584 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  23.62 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  22.36 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  22.69 
 
 		 510 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  23.77 
 
 		 563 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  24.74 
 
 		 574 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  21.8 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  26.37 
 
 		 481 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  20.93 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  22.69 
 
 		 510 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  23.25 
 
 		 521 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  23.25 
 
 		 521 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  27.12 
 
 		 446 aa  46.2  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  22.5 
 
 		 509 aa  45.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  25.96 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  21.93 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  27.27 
 
 		 450 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  22.61 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  25.97 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  26.23 
 
 		 504 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 480 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  23.9 
 
 		 474 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  21.63 
 
 		 507 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  24.8 
 
 		 232 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  21.63 
 
 		 507 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  26.62 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  26.27 
 
 		 448 aa  43.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  22.04 
 
 		 402 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  26.92 
 
 		 494 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  25.81 
 
 		 506 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0725  DNA repair protein RadA  23.43 
 
 		 441 aa  42.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.573014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>