More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3829 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  837    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  76.71 
 
 		 429 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  71.18 
 
 		 425 aa  554  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  63.05 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  63.05 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  63.3 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  60 
 
 		 424 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  57.57 
 
 		 418 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  58.07 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  56.72 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  52.9 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  52.9 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  52.9 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  52.9 
 
 		 413 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  52.9 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  53.17 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  52.28 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  51.5 
 
 		 411 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  44.65 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 426 aa  269  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 411 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  39.57 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 412 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 366 aa  163  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  40.96 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 615 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  36.49 
 
 		 544 aa  89.7  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 376 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 410 aa  67  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.21 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  24.11 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02665  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02010)  23.47 
 
 		 541 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 396 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.17 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  23.7 
 
 		 685 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  33.33 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  22.07 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.16 
 
 		 430 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  26.28 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.92 
 
 		 525 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.16 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.82 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.82 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  27.8 
 
 		 393 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 395 aa  53.5  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 420 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  27.83 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.98 
 
 		 538 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.85 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  24.61 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>