More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6188 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 560 aa  1142    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  43.2 
 
 		 564 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  42.72 
 
 		 568 aa  428  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  40.53 
 
 		 563 aa  333  7.000000000000001e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  32.46 
 
 		 567 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  30.74 
 
 		 547 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 		 627 aa  230  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  32.85 
 
 		 554 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  30.5 
 
 		 565 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 597 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.54 
 
 		 551 aa  210  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 561 aa  204  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 531 aa  203  7e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 569 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  29.06 
 
 		 553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  30.34 
 
 		 579 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 557 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 559 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 		 548 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 		 557 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 576 aa  183  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 		 567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.36 
 
 		 545 aa  177  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  28.13 
 
 		 572 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 557 aa  163  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 551 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 557 aa  160  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.32 
 
 		 556 aa  160  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 540 aa  158  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  25.78 
 
 		 560 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 559 aa  157  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.16 
 
 		 552 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  27.76 
 
 		 577 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 		 580 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 565 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  25.41 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 579 aa  146  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 576 aa  144  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.59 
 
 		 563 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 636 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.67 
 
 		 609 aa  135  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 645 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 604 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 560 aa  127  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 604 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  27.26 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 587 aa  120  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.14 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  26.93 
 
 		 523 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.74 
 
 		 556 aa  110  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.02 
 
 		 589 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  26.56 
 
 		 605 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  24.4 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 596 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 544 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.54 
 
 		 546 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 537 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.51 
 
 		 588 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.24 
 
 		 525 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.82 
 
 		 572 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  27.77 
 
 		 516 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 596 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 517 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 544 aa  100  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 564 aa  100  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 		 553 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 522 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 659 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 544 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  26.93 
 
 		 549 aa  99  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.17 
 
 		 515 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  25.58 
 
 		 526 aa  97.8  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.45 
 
 		 510 aa  97.8  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.58 
 
 		 526 aa  97.8  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 512 aa  97.4  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 526 aa  97.4  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.31 
 
 		 524 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 596 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.72 
 
 		 567 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  22.52 
 
 		 566 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 555 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 510 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  24.44 
 
 		 518 aa  95.1  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.73 
 
 		 511 aa  94.7  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 594 aa  94.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 		 629 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>