More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2979 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  100 
 
 		 655 aa  1343    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  31.46 
 
 		 620 aa  299  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.1 
 
 		 513 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.09 
 
 		 567 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  27.02 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  29.98 
 
 		 503 aa  156  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  29.12 
 
 		 497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  28.57 
 
 		 531 aa  146  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  28.53 
 
 		 485 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  28.32 
 
 		 485 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  32.17 
 
 		 531 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.17 
 
 		 485 aa  143  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  30.11 
 
 		 526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  27.46 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  29.01 
 
 		 519 aa  140  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  29.65 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.3 
 
 		 485 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.74 
 
 		 529 aa  137  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.38 
 
 		 485 aa  137  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.38 
 
 		 485 aa  137  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.96 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.39 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.88 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  31.46 
 
 		 533 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  31.46 
 
 		 533 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  31.46 
 
 		 533 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  30.77 
 
 		 531 aa  134  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.25 
 
 		 485 aa  134  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  28.78 
 
 		 544 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.87 
 
 		 485 aa  133  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  31.58 
 
 		 533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  25.57 
 
 		 530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.53 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  30.79 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.58 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  29.15 
 
 		 551 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  30.14 
 
 		 562 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.03 
 
 		 803 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  29.86 
 
 		 566 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  27.45 
 
 		 517 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  25.82 
 
 		 485 aa  124  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  30.64 
 
 		 550 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  27.29 
 
 		 536 aa  124  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.54 
 
 		 539 aa  123  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  30.86 
 
 		 499 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  26.22 
 
 		 591 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  26.75 
 
 		 603 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  28.3 
 
 		 822 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  26.16 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  25.9 
 
 		 389 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  26.01 
 
 		 533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  28.41 
 
 		 544 aa  114  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  28.11 
 
 		 547 aa  114  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  25.68 
 
 		 380 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  28.09 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.14 
 
 		 453 aa  112  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.03 
 
 		 601 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  28.97 
 
 		 519 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  23.42 
 
 		 385 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  26.49 
 
 		 363 aa  107  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.04 
 
 		 385 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.87 
 
 		 463 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  27 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.08 
 
 		 498 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  24.25 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.57 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.57 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.51 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.07 
 
 		 505 aa  102  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.76 
 
 		 483 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  24.52 
 
 		 595 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.61 
 
 		 481 aa  101  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  26.41 
 
 		 490 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  25.21 
 
 		 447 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  26.57 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  23.66 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  24.26 
 
 		 530 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.04 
 
 		 480 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  23.66 
 
 		 455 aa  99  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  25.96 
 
 		 483 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  24.18 
 
 		 466 aa  97.4  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  24.93 
 
 		 357 aa  96.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  25.43 
 
 		 466 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  26.23 
 
 		 359 aa  96.3  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  23.37 
 
 		 486 aa  95.5  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  22.38 
 
 		 426 aa  95.1  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  25.42 
 
 		 444 aa  94.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  25.78 
 
 		 507 aa  94  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  25.67 
 
 		 464 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  24.35 
 
 		 377 aa  92.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  30.3 
 
 		 345 aa  92.8  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  26.67 
 
 		 445 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  27.86 
 
 		 437 aa  92.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.48 
 
 		 551 aa  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  24.62 
 
 		 717 aa  91.3  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  27.43 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  23.68 
 
 		 588 aa  90.1  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  26.87 
 
 		 462 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.6 
 
 		 405 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  27.7 
 
 		 389 aa  89.7  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>