More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2941 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0071  hypothetical protein  35.91 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.677177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.57 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.97 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.23 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 		 289 aa  89  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.79 
 
 		 150 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  25.66 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  27.14 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  27.81 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  37.18 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  37.18 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  27.55 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.66 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.68 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.99 
 
 		 139 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  26.17 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  27.08 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.89 
 
 		 151 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.69 
 
 		 153 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  32.65 
 
 		 154 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  26.1 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.82 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  28.87 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.28 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  28.87 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  28.14 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  26.3 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  28.12 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  23.43 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  30.28 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  24.24 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  26.07 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.77 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  23.37 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.04 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  37.18 
 
 		 169 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.69 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  28.76 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.37 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.03 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.97 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  24.3 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.62 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  23.59 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.89 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  26.58 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  25.85 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.94 
 
 		 149 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  31.21 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  26.71 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.29 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  25.77 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.79 
 
 		 155 aa  67  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  23.84 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.27 
 
 		 145 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  28.95 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.95 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.12 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  24.6 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  27.27 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.44 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  22.56 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  26.06 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.28 
 
 		 147 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  26.83 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  26.19 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.78 
 
 		 150 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  32.43 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  22.53 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.83 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  25.25 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.43 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  31.54 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 160 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  24.76 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  25.34 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  31.76 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.96 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.78 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  24.41 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  25.61 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  27.21 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  25.59 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  26.35 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  23.93 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  24.36 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.59 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  23.57 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  30.22 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>