76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1500 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  100 
 
 		 448 aa  905    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  54.95 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  41.96 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 495 aa  365  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 		 509 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  39.21 
 
 		 498 aa  353  5e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  37.78 
 
 		 493 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  43.06 
 
 		 428 aa  316  5e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 458 aa  306  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  40.41 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  60.54 
 
 		 507 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  54.94 
 
 		 529 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  59.36 
 
 		 551 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  59.72 
 
 		 530 aa  277  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  52.85 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  52.85 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  52.85 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  57.58 
 
 		 531 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  57.58 
 
 		 531 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  52.47 
 
 		 551 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  59.26 
 
 		 531 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  57.99 
 
 		 519 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  55.36 
 
 		 518 aa  269  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  58.18 
 
 		 505 aa  269  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  58.26 
 
 		 524 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  53.67 
 
 		 502 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  54.13 
 
 		 502 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  32.88 
 
 		 450 aa  241  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  32.43 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  56.95 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  31.34 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  33.08 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  51.79 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  28.44 
 
 		 471 aa  206  5e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  31.38 
 
 		 453 aa  199  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  28.52 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  21.97 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  24.05 
 
 		 674 aa  69.7  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  30 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  28.75 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  28.12 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 461 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 411 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  34 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  23.82 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  28.22 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  20.95 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  31.31 
 
 		 479 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  23.15 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  26.73 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 505 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  29.13 
 
 		 445 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 460 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>