81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1980 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  100 
 
 		 203 aa  391  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  43.67 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  43.04 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  45.52 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  40.88 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  39.07 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  42.61 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  46.04 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  38.92 
 
 		 448 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  41.48 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  50 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  33.81 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  44.44 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  42.42 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  51.95 
 
 		 519 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  36.81 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  34.24 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  38.81 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  35 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  36.25 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  36.25 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  34.78 
 
 		 339 aa  58.2  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  38.18 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  35.54 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  29.93 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  28.99 
 
 		 321 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 287 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  31.62 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  35.11 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  32.81 
 
 		 416 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 326 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  28.17 
 
 		 311 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  28.17 
 
 		 311 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  28.77 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 426 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  28.97 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  38.46 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  26.28 
 
 		 287 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 313 aa  48.5  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 312 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  29.23 
 
 		 329 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  26.34 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 314 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  28.77 
 
 		 306 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0479  type II secretion system protein  38.52 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00167039  hitchhiker  0.0082018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  25.35 
 
 		 313 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 326 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  25.87 
 
 		 318 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 323 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  41.84 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  35.07 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 331 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  28.87 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.15 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  28.77 
 
 		 306 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  34.42 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  28.17 
 
 		 293 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 302 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 323 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 303 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  29.22 
 
 		 292 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 314 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  27.03 
 
 		 326 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 323 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  27.72 
 
 		 296 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 328 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  28.83 
 
 		 325 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  26.53 
 
 		 321 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 325 aa  41.6  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 318 aa  41.2  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 299 aa  41.2  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>