136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0185 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  100 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  59.57 
 
 
240 aa  276  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  56.85 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  57.81 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  57.74 
 
 
240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  58.26 
 
 
263 aa  270  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  57.32 
 
 
240 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  59.4 
 
 
239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  59.09 
 
 
272 aa  256  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  54.75 
 
 
259 aa  248  5e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  54.3 
 
 
259 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  50.2 
 
 
259 aa  244  8e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  53.85 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  55.35 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  50.85 
 
 
241 aa  238  5.999999999999999e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  48.97 
 
 
247 aa  236  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  53.39 
 
 
238 aa  234  8e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  48.09 
 
 
240 aa  229  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  49.79 
 
 
271 aa  226  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  47.9 
 
 
242 aa  222  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  45.68 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  47.08 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  48.72 
 
 
251 aa  219  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  46.41 
 
 
241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  45.96 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  45.45 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  48.07 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  49.06 
 
 
243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  50.49 
 
 
256 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  53.2 
 
 
267 aa  208  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  44.96 
 
 
245 aa  193  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  41.3 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  44.96 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  40.16 
 
 
250 aa  184  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  41.63 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  40.59 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  43.93 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  41.92 
 
 
257 aa  180  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  43.68 
 
 
255 aa  177  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  42.18 
 
 
237 aa  176  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  41.45 
 
 
246 aa  175  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  46.49 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  44.21 
 
 
253 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  39.04 
 
 
235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  42.11 
 
 
231 aa  162  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  41.9 
 
 
250 aa  156  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  40.58 
 
 
285 aa  155  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  43.26 
 
 
264 aa  155  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  38.68 
 
 
252 aa  153  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  39.17 
 
 
233 aa  153  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  38.26 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  42.36 
 
 
280 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  38.32 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  40.1 
 
 
256 aa  142  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  33.87 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  37.29 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  33.46 
 
 
278 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  39.17 
 
 
246 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  39.44 
 
 
299 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  34.71 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  34.5 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  43.12 
 
 
259 aa  125  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  32.03 
 
 
247 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  31.49 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  33.04 
 
 
258 aa  115  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  29.31 
 
 
245 aa  115  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  33.33 
 
 
238 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  30.64 
 
 
250 aa  105  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  29.83 
 
 
269 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  34.66 
 
 
180 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  32.03 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  36.99 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  32.23 
 
 
210 aa  89.4  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  29.71 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  28 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  28.86 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.73 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  29.25 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  29.25 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  33.33 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  28.3 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  28.14 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.92 
 
 
203 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  29.67 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  31.05 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  33.33 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  28.11 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  28.77 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  30.59 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  32.35 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  32.97 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  32.35 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.64 
 
 
196 aa  72  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.02 
 
 
225 aa  72  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  31.76 
 
 
201 aa  72  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  29.24 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  28.74 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  28.64 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  30.81 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  25.41 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>