131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0693 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  96.18 
 
 		 471 aa  892    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 471 aa  977    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  54.08 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  51.52 
 
 		 483 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  51.52 
 
 		 483 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  49.07 
 
 		 598 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  47 
 
 		 803 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  60.97 
 
 		 353 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  46.09 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  47.44 
 
 		 727 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  48.22 
 
 		 729 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  48.22 
 
 		 729 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  46.3 
 
 		 565 aa  292  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  46.47 
 
 		 699 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  35.41 
 
 		 1113 aa  162  2e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  29.65 
 
 		 846 aa  120  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  28.12 
 
 		 846 aa  120  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.24 
 
 		 1362 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  28.28 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  28.28 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  28.28 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  28.84 
 
 		 848 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  27.99 
 
 		 360 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  27.92 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  28.25 
 
 		 846 aa  110  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  30.46 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  28.28 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  28.15 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.41 
 
 		 648 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  28.57 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.2 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 360 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  28.08 
 
 		 360 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  25.34 
 
 		 376 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 		 551 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 1578 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  29.3 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  29.62 
 
 		 516 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  31.93 
 
 		 460 aa  90.5  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  25.48 
 
 		 680 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.88 
 
 		 551 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  32.53 
 
 		 468 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  30.9 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  33.09 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  36 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  33.09 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  33.09 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  31.88 
 
 		 749 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.38 
 
 		 465 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  32.12 
 
 		 660 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  24.66 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  39.39 
 
 		 762 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  41.18 
 
 		 743 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  26.71 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  23.29 
 
 		 582 aa  64.3  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  29.17 
 
 		 787 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 		 1137 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  38.27 
 
 		 973 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  28.97 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  34 
 
 		 649 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  35.29 
 
 		 900 aa  60.1  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  41.18 
 
 		 608 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 1209 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  35.63 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  36.47 
 
 		 655 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 1121 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.65 
 
 		 6885 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  39.51 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  29.58 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  29.58 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  32.61 
 
 		 703 aa  57  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  35.79 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  35.79 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  34.74 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.28 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  35.79 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  39.44 
 
 		 1298 aa  55.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  26.09 
 
 		 680 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  39.76 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  35.56 
 
 		 1160 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  35.87 
 
 		 667 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  29.79 
 
 		 456 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  32.94 
 
 		 503 aa  53.5  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  38.27 
 
 		 455 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.02 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.02 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  39.02 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.02 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.02 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  39.02 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  39.02 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 809 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  34.21 
 
 		 651 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50155  chitinase chitin binding glycoside hydrolase family 1  29.58 
 
 		 525 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.487357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.35 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>