190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3323 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  100 
 
 		 163 aa  320  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  42.5 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  45.73 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  37.42 
 
 		 221 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  46.38 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  44.83 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  46.92 
 
 		 214 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  47.3 
 
 		 227 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  34.38 
 
 		 184 aa  110  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  46.62 
 
 		 227 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  47.41 
 
 		 227 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  51.49 
 
 		 192 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  42.66 
 
 		 189 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  42.66 
 
 		 189 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  42.54 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  46.51 
 
 		 214 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  50 
 
 		 185 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  47.29 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  39.75 
 
 		 358 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  43.51 
 
 		 195 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  41.13 
 
 		 211 aa  100  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  42.14 
 
 		 172 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  41.51 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  44.36 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  41.38 
 
 		 167 aa  94  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  39.84 
 
 		 242 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  37.11 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  39.13 
 
 		 534 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  39.24 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  35.21 
 
 		 241 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  39.39 
 
 		 177 aa  84  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  39.39 
 
 		 177 aa  84  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  36.15 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  43.9 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  39.23 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  36.15 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  39.2 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  32.7 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  40.77 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  40.17 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.67 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  33.81 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  39.6 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  26.67 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.67 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  40.77 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  30.86 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  40.3 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  36.65 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  36.64 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  35.34 
 
 		 208 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.71 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  37.58 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  40.62 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  37.32 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  36.17 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.59 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  43.86 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  40.31 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  37.9 
 
 		 263 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  38.06 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.54 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  27.59 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.88 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  32 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  36.57 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  31.54 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  31.54 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.69 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.46 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  38.81 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  33.14 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4353  hypothetical protein  32.65 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  28.4 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  29.59 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.58 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  31.62 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  33.87 
 
 		 286 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.48 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  33.33 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  32.31 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  34.1 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  32.45 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  35.29 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  33.14 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  33.33 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  36.81 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  40.86 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  33.33 
 
 		 225 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.72 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30.25 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  33.08 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  34.19 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  29.45 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  40.43 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  30.37 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  35.59 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  30.71 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>