More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2073 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  83.26 
 
 
478 aa  703  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  82.22 
 
 
474 aa  711  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  83.48 
 
 
478 aa  703  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  77.42 
 
 
472 aa  676  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  83.71 
 
 
478 aa  705  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
467 aa  912  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  83.71 
 
 
478 aa  705  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  87.07 
 
 
474 aa  725  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  83.48 
 
 
478 aa  704  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  83.48 
 
 
478 aa  704  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  87.07 
 
 
473 aa  726  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  85.3 
 
 
473 aa  694  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  83.48 
 
 
478 aa  704  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  86.1 
 
 
474 aa  726  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  78.06 
 
 
472 aa  682  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  85.87 
 
 
474 aa  724  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  82.52 
 
 
476 aa  697  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  70.13 
 
 
455 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  68.85 
 
 
455 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  69.56 
 
 
459 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  82.78 
 
 
398 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  58.08 
 
 
457 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  59.33 
 
 
451 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  57.17 
 
 
451 aa  498  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  55.64 
 
 
514 aa  469  1e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  43.61 
 
 
509 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  39.02 
 
 
447 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 
451 aa  303  5e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 
456 aa  283  4e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  39.91 
 
 
477 aa  279  8e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  37.58 
 
 
438 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
473 aa  271  3e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  38.24 
 
 
485 aa  266  6e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 
435 aa  265  9e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  35.16 
 
 
456 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  34.84 
 
 
399 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.23204e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  34.61 
 
 
399 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  34.61 
 
 
399 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.22558e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  34.61 
 
 
399 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.80591e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  34.61 
 
 
399 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  34.37 
 
 
399 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.25853e-08  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  34.37 
 
 
399 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.69498e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.61 
 
 
399 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.59613e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.37 
 
 
399 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.05464e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  35 
 
 
399 aa  256  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 
398 aa  254  2e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  34.13 
 
 
399 aa  253  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.14177e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
470 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 
398 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.27195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 
447 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 
465 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 
445 aa  245  1e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  36.13 
 
 
449 aa  242  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.18 
 
 
468 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.98546e-05  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
466 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  32.82 
 
 
459 aa  222  1e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  32.97 
 
 
460 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  34.07 
 
 
463 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
404 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 
460 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  34.4 
 
 
437 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  35.34 
 
 
415 aa  214  2e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.54 
 
 
464 aa  214  2e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  32.64 
 
 
438 aa  213  8e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 
459 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
461 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  30.68 
 
 
438 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 
462 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.77 
 
 
450 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  31.34 
 
 
526 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.6 
 
 
462 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  1.09951e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  33.48 
 
 
478 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  35.76 
 
 
464 aa  204  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.97 
 
 
462 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
473 aa  199  1e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
470 aa  198  2e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
467 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
467 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.73 
 
 
474 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  9.73666e-10  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  32.4 
 
 
492 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  33.62 
 
 
455 aa  193  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  32.12 
 
 
462 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  32.03 
 
 
462 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.74 
 
 
468 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  31.38 
 
 
472 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  31.14 
 
 
475 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  32.14 
 
 
468 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
459 aa  189  6e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  31.36 
 
 
475 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  32.87 
 
 
430 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  31.08 
 
 
472 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  30.28 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  30.28 
 
 
479 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
446 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  32.68 
 
 
467 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  30.84 
 
 
436 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  33.04 
 
 
434 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  27.76 
 
 
388 aa  186  1e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  31.32 
 
 
472 aa  185  2e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.32 
 
 
472 aa  185  2e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>