More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2449 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  100 
 
 		 162 aa  326  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  45.1 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  42.03 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  42.17 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  43.48 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  42.17 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.73 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  35.22 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  44.09 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  37.89 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  41.45 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.27 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  40.94 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  50.44 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  65.45 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  51.16 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  38.51 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  32.89 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  42.72 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  51.39 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  35.67 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  66 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  61.67 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  42.73 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  66.67 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  72.34 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  66.67 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  39.86 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2475  N-terminal methylation site  35.21 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  46.24 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  57.38 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  32.89 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  51.35 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  57.38 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  46.59 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  42.86 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  51.52 
 
 		 446 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  33.12 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  51.52 
 
 		 438 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  42.99 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  71.11 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  44.32 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  58.93 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  36.91 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2242  fimbrial protein pilin  38.36 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  39.8 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  40.65 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  47.69 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  40.38 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  66.67 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  51.32 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  64.15 
 
 		 134 aa  67  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  55.74 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  56.36 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  65.12 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  52.24 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  63.04 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  46.97 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  63.04 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  58.49 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  71.11 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  42.72 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  42.72 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  27.27 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  46.38 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  27.27 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  58.7 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  41.75 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  41.75 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  41.75 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0441  Fimbrial protein pilin  36.9 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.63 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  57.45 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  59.57 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  57.78 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  40.71 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.86 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  30.17 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  55.1 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  62.75 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  33.56 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  32.54 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  73.81 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  40.91 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  46.91 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  63.46 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  37.66 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  52.63 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4781  Tfp pilus assembly protein  39.64 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  87.88 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  27.92 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  29.07 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  47.95 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  60 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  32.21 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  65.91 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  38.26 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  37.14 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  60.47 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  60.47 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>