More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1451 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  253  6e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  99.09 
 
 		 110 aa  214  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  35.11 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  43.75 
 
 		 516 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  43.94 
 
 		 508 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  51.92 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.71 
 
 		 517 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 513 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  40.35 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  42.11 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  42.11 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 490 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  34.21 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 497 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  39.68 
 
 		 509 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  43.86 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  32.56 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 503 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 197 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 513 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 183 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  34.74 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0098  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.82 
 
 		 305 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1143 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4177  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  40.3 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 512 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  33.73 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.72 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  51.28 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0841  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000196105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  36.49 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3749  helix-turn-helix domain protein  30.86 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2419  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.26 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4071  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0390  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.945426 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1851  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 160 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  35.19 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 210 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>