18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3749 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3749  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  30.86 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40.26 
 
 		 508 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  34.62 
 
 		 517 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  26.56 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2712  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1563  repressor protein CI homolog  38.89 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0490  Fis family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 184 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>