More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1348 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  100 
 
 
157 aa  312  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  34.81 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  34.62 
 
 
165 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  34.62 
 
 
165 aa  84  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  35.85 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  30.13 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  0.00000022804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  30.19 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  32.26 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  30.82 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  34 
 
 
140 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  34.64 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  38.82 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  31.74 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  30.72 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  28.93 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  35.14 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  36.63 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.56 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  32.1 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.87 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.67 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.49 
 
 
290 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.33 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.26 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  36.13 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  28.83 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32.43 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
137 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.97 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
128 aa  58.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.57 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.13 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.67 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.45 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.73 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  31.41 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.8 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.33 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  34.62 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30.46 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  33.06 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.94 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  32.88 
 
 
280 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  29.56 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  34.29 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.11 
 
 
180 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.53 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  31.14 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  38.24 
 
 
221 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  29.49 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  27.61 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  38.96 
 
 
281 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.68 
 
 
300 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.33 
 
 
320 aa  54.3  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.48 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.92 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  24.38 
 
 
515 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  39.68 
 
 
173 aa  53.9  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  29.87 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.41 
 
 
297 aa  53.9  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  53.9  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  25 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.11 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  25 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  32.03 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.22 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  25 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  32.03 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.19 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  25 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.22 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  30 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  42.47 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  27.52 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  29.56 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  25 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>