More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1772 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  53.03 
 
 		 612 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  52.59 
 
 		 632 aa  656    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  100 
 
 		 619 aa  1285    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  52.69 
 
 		 593 aa  633  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  49.92 
 
 		 601 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  50.08 
 
 		 615 aa  618  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  51.48 
 
 		 610 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  48.19 
 
 		 616 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  47.33 
 
 		 607 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  45.14 
 
 		 619 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  42.77 
 
 		 613 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  40.77 
 
 		 616 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  44.55 
 
 		 625 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  38.8 
 
 		 615 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  43.21 
 
 		 314 aa  231  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.05 
 
 		 607 aa  188  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  27.03 
 
 		 593 aa  177  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  24.53 
 
 		 588 aa  127  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  29.33 
 
 		 815 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  30.57 
 
 		 752 aa  101  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  30.74 
 
 		 696 aa  100  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.74 
 
 		 737 aa  100  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  30.04 
 
 		 706 aa  98.6  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  21.46 
 
 		 568 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  20.68 
 
 		 827 aa  97.8  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  31.72 
 
 		 695 aa  97.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  28.68 
 
 		 819 aa  95.9  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  24.92 
 
 		 617 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  28.68 
 
 		 699 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  25.18 
 
 		 1136 aa  89  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  29.17 
 
 		 703 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  29.17 
 
 		 703 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  29.48 
 
 		 705 aa  87.4  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  31.48 
 
 		 712 aa  87  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  24.1 
 
 		 559 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  31.09 
 
 		 663 aa  85.5  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  24.46 
 
 		 579 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  27.52 
 
 		 711 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 737 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  30.89 
 
 		 697 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  28.2 
 
 		 705 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  28.85 
 
 		 734 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  31.42 
 
 		 710 aa  81.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  27.72 
 
 		 704 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.72 
 
 		 704 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  27.72 
 
 		 704 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  28.52 
 
 		 690 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 708 aa  80.9  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  27.24 
 
 		 679 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 716 aa  80.1  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  20.13 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  28.05 
 
 		 617 aa  77.8  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  27.24 
 
 		 673 aa  77.8  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 714 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3988  hypothetical protein  55.56 
 
 		 57 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00319492  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  29.52 
 
 		 683 aa  75.5  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  27.59 
 
 		 717 aa  73.9  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  24.11 
 
 		 388 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  22.9 
 
 		 574 aa  73.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  26.23 
 
 		 554 aa  73.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.49 
 
 		 696 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  24.11 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  26.14 
 
 		 659 aa  70.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  24.16 
 
 		 631 aa  70.5  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  27.21 
 
 		 695 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 712 aa  67.4  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1726  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 593 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  27.07 
 
 		 687 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  26.58 
 
 		 755 aa  65.1  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  23.14 
 
 		 606 aa  64.3  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  25.66 
 
 		 685 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  29.6 
 
 		 759 aa  62  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 821 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  22.94 
 
 		 723 aa  60.8  0.00000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 		 1142 aa  60.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  26.91 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  29.28 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  28.27 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  23.66 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  31.97 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  37.37 
 
 		 737 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  25.74 
 
 		 702 aa  58.5  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  20.62 
 
 		 722 aa  57.8  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  23.29 
 
 		 1107 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  26.46 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.14 
 
 		 798 aa  57.4  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  25.75 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03301  UvrD/REP helicase  41.98 
 
 		 809 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.479147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  25.37 
 
 		 689 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  39.36 
 
 		 1001 aa  57  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25591  UvrD/REP helicase  45.71 
 
 		 802 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  43.42 
 
 		 745 aa  57  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1715  UvrD/REP helicase  25.3 
 
 		 462 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000356586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  27.8 
 
 		 700 aa  57  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  26.1 
 
 		 689 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2446  UvrD/REP helicase  27.42 
 
 		 1141 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>