238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2302 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  100 
 
 		 607 aa  1253    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  41.38 
 
 		 593 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  29.09 
 
 		 632 aa  221  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  27.53 
 
 		 593 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  27.06 
 
 		 613 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  28.28 
 
 		 619 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  26.05 
 
 		 619 aa  188  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  26.76 
 
 		 610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  26.98 
 
 		 612 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  27.74 
 
 		 616 aa  184  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  26.7 
 
 		 616 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  26.07 
 
 		 607 aa  180  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  27.93 
 
 		 615 aa  177  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.4 
 
 		 601 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  24.71 
 
 		 625 aa  156  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  27.26 
 
 		 615 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  25.12 
 
 		 588 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  30.88 
 
 		 314 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  22.91 
 
 		 568 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  25.3 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  22.73 
 
 		 827 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  24.68 
 
 		 631 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  24.25 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  26.74 
 
 		 559 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  26.22 
 
 		 815 aa  73.9  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  24.59 
 
 		 579 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  23.36 
 
 		 830 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  23.13 
 
 		 830 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  27.72 
 
 		 752 aa  66.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  24.94 
 
 		 606 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  22.76 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 		 697 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  28.37 
 
 		 711 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  27.1 
 
 		 717 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  24.16 
 
 		 679 aa  61.6  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 695 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  25.71 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  30.41 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 705 aa  57  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  27 
 
 		 704 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  27 
 
 		 704 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27 
 
 		 704 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  23.17 
 
 		 549 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 		 697 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  30.93 
 
 		 719 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  30.14 
 
 		 669 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  30.14 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  30.14 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  30.14 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  30.14 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  30.14 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  30.14 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  23.16 
 
 		 563 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  29.29 
 
 		 555 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.84 
 
 		 673 aa  55.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  23.16 
 
 		 563 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  26.39 
 
 		 737 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  32.79 
 
 		 335 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  29.29 
 
 		 555 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  26.32 
 
 		 541 aa  54.7  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 705 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  28.67 
 
 		 555 aa  53.9  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  26.85 
 
 		 557 aa  53.9  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  26.85 
 
 		 557 aa  53.9  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  26.24 
 
 		 710 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  28.76 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  26.85 
 
 		 557 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  25.1 
 
 		 714 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.37 
 
 		 663 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  29.66 
 
 		 737 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.52 
 
 		 677 aa  52.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  30.5 
 
 		 544 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  23.51 
 
 		 673 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  39.73 
 
 		 669 aa  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  24.3 
 
 		 699 aa  51.6  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  31.2 
 
 		 555 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  24.83 
 
 		 703 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  24.83 
 
 		 703 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  23.96 
 
 		 551 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  23.44 
 
 		 662 aa  51.2  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  29.86 
 
 		 557 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  24.17 
 
 		 726 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  19.77 
 
 		 634 aa  50.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  23.06 
 
 		 574 aa  50.8  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.84 
 
 		 660 aa  50.8  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  26.4 
 
 		 1715 aa  50.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  24.17 
 
 		 726 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.21 
 
 		 737 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  37.18 
 
 		 1132 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.1 
 
 		 1469 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  24.12 
 
 		 663 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  31.2 
 
 		 742 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  26.18 
 
 		 720 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  33.96 
 
 		 744 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  31.75 
 
 		 687 aa  49.7  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  29.11 
 
 		 754 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  23.05 
 
 		 696 aa  48.9  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>