79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1680 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 568 aa  1174    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  33.39 
 
 		 574 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  32.76 
 
 		 559 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  29.42 
 
 		 579 aa  210  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  26.39 
 
 		 551 aa  160  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  25.72 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  25.72 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  25.27 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  27.56 
 
 		 550 aa  154  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  25.48 
 
 		 606 aa  150  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  25.31 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  24.17 
 
 		 555 aa  123  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  26.02 
 
 		 632 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  24.71 
 
 		 527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  24.06 
 
 		 593 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  24.5 
 
 		 554 aa  107  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  28.32 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  24.13 
 
 		 625 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  23.78 
 
 		 616 aa  100  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  21.46 
 
 		 619 aa  98.6  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  24.76 
 
 		 541 aa  97.8  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  22.15 
 
 		 615 aa  95.9  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  22.42 
 
 		 601 aa  95.1  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  23 
 
 		 607 aa  92  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  22.41 
 
 		 612 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  23.03 
 
 		 619 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  24.34 
 
 		 540 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  24.63 
 
 		 626 aa  87.8  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  25.97 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  23.89 
 
 		 578 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2836  NERD domain protein  29.61 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3287  NERD domain protein  29.61 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  22.91 
 
 		 607 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  24.49 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  24.49 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  24.49 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  24.49 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  24.49 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  24.49 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  24.49 
 
 		 669 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  23.74 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  23.74 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  26.19 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  22.67 
 
 		 555 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  24.92 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  22.54 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  22.9 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  24.48 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  21.47 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  22.68 
 
 		 616 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  22.38 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  23.91 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  23.82 
 
 		 555 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  23.96 
 
 		 610 aa  73.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  24.18 
 
 		 564 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  28.57 
 
 		 617 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  23.7 
 
 		 593 aa  67  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  20.94 
 
 		 615 aa  63.9  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  26.63 
 
 		 827 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  28.14 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1058  hypothetical protein  26.7 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0139648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  22.31 
 
 		 588 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  25.69 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  28.22 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  24 
 
 		 631 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  22.1 
 
 		 634 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 663 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2753  hypothetical protein  34.95 
 
 		 129 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.148291 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  34.74 
 
 		 698 aa  49.7  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  22.95 
 
 		 830 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  23.98 
 
 		 726 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  23.98 
 
 		 726 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  25.99 
 
 		 388 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  25.59 
 
 		 695 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  22.71 
 
 		 830 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  25.76 
 
 		 662 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  34.21 
 
 		 719 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  21.63 
 
 		 660 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0350  DNA helicase II related protein, putative  30 
 
 		 394 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00193946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>