188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4891 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  62.68 
 
 		 613 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1283    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  45.16 
 
 		 616 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  40.77 
 
 		 619 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  40.89 
 
 		 632 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  36.69 
 
 		 615 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  38.13 
 
 		 601 aa  438  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  38.1 
 
 		 593 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  37.15 
 
 		 610 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  38.12 
 
 		 619 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  37.44 
 
 		 607 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  37.62 
 
 		 612 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  33.05 
 
 		 625 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  32.32 
 
 		 615 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  42.29 
 
 		 314 aa  226  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.7 
 
 		 607 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  27.17 
 
 		 593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  26.34 
 
 		 617 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  23.05 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  23.69 
 
 		 827 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  27.34 
 
 		 815 aa  90.9  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  28.63 
 
 		 708 aa  90.9  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  23.87 
 
 		 673 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  22.18 
 
 		 737 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  21.57 
 
 		 574 aa  85.5  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  22.18 
 
 		 696 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  23.33 
 
 		 631 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  23.94 
 
 		 617 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 		 699 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 690 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  20.78 
 
 		 559 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  27.45 
 
 		 717 aa  80.5  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  26.48 
 
 		 734 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 706 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  25.78 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.44 
 
 		 696 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  22.68 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  23.64 
 
 		 662 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  26.24 
 
 		 712 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  26.57 
 
 		 819 aa  74.3  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  24.87 
 
 		 541 aa  73.9  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  24.45 
 
 		 716 aa  71.2  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  22.47 
 
 		 579 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  24.33 
 
 		 752 aa  70.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  28.35 
 
 		 683 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  23.41 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 737 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 697 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 		 714 aa  67.8  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  23.64 
 
 		 703 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  23.64 
 
 		 703 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  26.36 
 
 		 705 aa  67  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  22.76 
 
 		 549 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  26.83 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  22.5 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  20.65 
 
 		 563 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  20.65 
 
 		 563 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  22.5 
 
 		 726 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  25.1 
 
 		 712 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  24.3 
 
 		 809 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 655 aa  61.6  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  26.1 
 
 		 830 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  27.27 
 
 		 691 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  27.24 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  24.44 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  25.74 
 
 		 830 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  22.61 
 
 		 671 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 630 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  23.36 
 
 		 687 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  27.67 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  26.88 
 
 		 689 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  26.88 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  26.88 
 
 		 689 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  22.52 
 
 		 685 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  27.97 
 
 		 712 aa  58.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  27.34 
 
 		 759 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  26.48 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  22.91 
 
 		 1136 aa  57.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  26.48 
 
 		 689 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  26.09 
 
 		 689 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.71 
 
 		 1107 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1058  hypothetical protein  23.91 
 
 		 396 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0139648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  28.06 
 
 		 695 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  21.99 
 
 		 557 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  24.62 
 
 		 704 aa  57  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 704 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.62 
 
 		 704 aa  57  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  26.88 
 
 		 689 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  29.14 
 
 		 544 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  29.09 
 
 		 1142 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 745 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  21.53 
 
 		 603 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  25.69 
 
 		 691 aa  54.7  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  20.41 
 
 		 564 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  22.69 
 
 		 705 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0732  UvrD/REP helicase  23.95 
 
 		 929 aa  54.3  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.44 
 
 		 1469 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  22.48 
 
 		 554 aa  53.5  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  22.97 
 
 		 550 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>