15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3988 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3988  hypothetical protein  100 
 
 
57 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00319492  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  73.68 
 
 
601 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  71.93 
 
 
610 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  64.91 
 
 
615 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  66.67 
 
 
607 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  64.15 
 
 
593 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  55.56 
 
 
619 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  57.41 
 
 
612 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  44.44 
 
 
616 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  50.91 
 
 
619 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  46.3 
 
 
632 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  46.3 
 
 
314 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  38.89 
 
 
613 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  38.89 
 
 
616 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  42.59 
 
 
615 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>