More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2839 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  100 
 
 
689 aa  1405    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  95.94 
 
 
689 aa  1356    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  95.5 
 
 
689 aa  1353    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  96.08 
 
 
689 aa  1355    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  93.6 
 
 
691 aa  1328    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  92.73 
 
 
691 aa  1317    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  95.94 
 
 
689 aa  1356    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  96.37 
 
 
689 aa  1340    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  92.3 
 
 
691 aa  1317    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  95.5 
 
 
689 aa  1348    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  44.31 
 
 
712 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.46 
 
 
763 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.17 
 
 
763 aa  399  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  34.29 
 
 
760 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  34.81 
 
 
755 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  33.59 
 
 
706 aa  326  9e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  33.13 
 
 
706 aa  326  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  30.96 
 
 
768 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.07 
 
 
753 aa  317  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  31.94 
 
 
702 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  30.82 
 
 
778 aa  301  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  33.18 
 
 
703 aa  300  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  32.1 
 
 
780 aa  296  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  29.14 
 
 
776 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  29.14 
 
 
776 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  29.14 
 
 
776 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  29.78 
 
 
777 aa  294  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  28.75 
 
 
776 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 
778 aa  290  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  30.68 
 
 
777 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  30.82 
 
 
702 aa  288  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  28.72 
 
 
785 aa  287  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  28.7 
 
 
777 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  29.81 
 
 
748 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.19 
 
 
768 aa  257  4e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  28.74 
 
 
762 aa  250  6e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  29.64 
 
 
764 aa  241  4e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  26.11 
 
 
666 aa  197  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.66 
 
 
670 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  25.45 
 
 
717 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.58 
 
 
659 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  24.22 
 
 
692 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.17 
 
 
672 aa  181  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  26.22 
 
 
680 aa  180  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  26.66 
 
 
695 aa  177  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25 
 
 
645 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.33 
 
 
710 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  25.23 
 
 
727 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.47 
 
 
736 aa  169  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.82 
 
 
724 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  34.26 
 
 
787 aa  164  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  26.25 
 
 
719 aa  164  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  24.38 
 
 
852 aa  163  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  40.19 
 
 
772 aa  162  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  24.74 
 
 
792 aa  162  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  22.82 
 
 
695 aa  152  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  24.36 
 
 
706 aa  150  9e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  25 
 
 
1048 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  35.02 
 
 
269 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  23.69 
 
 
684 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  36.84 
 
 
726 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.71 
 
 
813 aa  135  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.25 
 
 
733 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.09 
 
 
706 aa  134  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  37.32 
 
 
759 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  34.78 
 
 
758 aa  128  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.18 
 
 
698 aa  128  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  37.63 
 
 
679 aa  128  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.98 
 
 
832 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  22.83 
 
 
861 aa  127  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  35.41 
 
 
829 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  35.75 
 
 
799 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.89 
 
 
746 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.2 
 
 
716 aa  123  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  36.27 
 
 
724 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  36.22 
 
 
742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  35.78 
 
 
724 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  35.78 
 
 
724 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  27.43 
 
 
734 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.06 
 
 
741 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.78 
 
 
766 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  34.91 
 
 
902 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.69 
 
 
748 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.42 
 
 
757 aa  120  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.84 
 
 
693 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  34.16 
 
 
759 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.47 
 
 
732 aa  119  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  36.79 
 
 
765 aa  118  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  34.18 
 
 
742 aa  117  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  35.22 
 
 
735 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  36.04 
 
 
771 aa  117  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  34.47 
 
 
750 aa  117  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  31.3 
 
 
754 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  34.54 
 
 
795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.76 
 
 
703 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.77 
 
 
767 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.18 
 
 
804 aa  114  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  31.06 
 
 
776 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  32.27 
 
 
703 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.69 
 
 
685 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>