46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0359 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  100 
 
 		 827 aa  1666    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0350  DNA helicase II related protein, putative  58.29 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00193946  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  35.98 
 
 		 634 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0349  DNA helicase II related protein, putative  49.11 
 
 		 237 aa  220  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.217591  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  26.62 
 
 		 617 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  24.26 
 
 		 617 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  24.33 
 
 		 631 aa  154  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  23.69 
 
 		 616 aa  100  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  20.68 
 
 		 619 aa  97.8  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  21.45 
 
 		 619 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  22.8 
 
 		 632 aa  95.1  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  21.04 
 
 		 593 aa  94  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  20.9 
 
 		 610 aa  88.6  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  21.68 
 
 		 588 aa  87.8  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  23.33 
 
 		 613 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  22.73 
 
 		 607 aa  81.3  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  21.36 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  19.09 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  22.22 
 
 		 616 aa  78.2  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  22.41 
 
 		 593 aa  77.4  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  20.31 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  20.14 
 
 		 615 aa  72  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  20.48 
 
 		 612 aa  68.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  18.72 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  20.38 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  26.63 
 
 		 568 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  20.8 
 
 		 574 aa  62.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  23.9 
 
 		 579 aa  62  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  19.77 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  26.67 
 
 		 540 aa  55.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  21.91 
 
 		 1136 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  23.2 
 
 		 557 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  26.26 
 
 		 544 aa  49.3  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  19.26 
 
 		 559 aa  48.5  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  24.64 
 
 		 388 aa  47.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  25.71 
 
 		 557 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3262  exonuclease V subunit alpha  37.5 
 
 		 607 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  24.12 
 
 		 557 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  23.81 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  24.12 
 
 		 557 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  25.14 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  24.1 
 
 		 551 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  23.21 
 
 		 555 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2150  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.33 
 
 		 604 aa  46.2  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00157683  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0770  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.92 
 
 		 579 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0335755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  31.65 
 
 		 748 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>