63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0285 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  100 
 
 		 540 aa  1082    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  88.33 
 
 		 541 aa  967    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  44.29 
 
 		 533 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  39.04 
 
 		 544 aa  323  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  37.36 
 
 		 555 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  37.66 
 
 		 555 aa  315  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  37.92 
 
 		 557 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  38.04 
 
 		 557 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  38.04 
 
 		 557 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  38.37 
 
 		 555 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  37.08 
 
 		 557 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  37.5 
 
 		 555 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  37.57 
 
 		 626 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  36.72 
 
 		 564 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  36.38 
 
 		 573 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  35.83 
 
 		 669 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  36.02 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  291  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  36.96 
 
 		 558 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  35.7 
 
 		 554 aa  249  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  24.69 
 
 		 559 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24.34 
 
 		 568 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  27.34 
 
 		 555 aa  85.9  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  27.01 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  25.93 
 
 		 550 aa  77.8  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  30.32 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  25.9 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  25.78 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  28.29 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  28.08 
 
 		 632 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  25.88 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  25.88 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  25.18 
 
 		 579 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  24.35 
 
 		 612 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  27.34 
 
 		 619 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  25.23 
 
 		 593 aa  67.4  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  23.38 
 
 		 613 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  29.28 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.71 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  26.42 
 
 		 527 aa  57  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  28.81 
 
 		 593 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  21.83 
 
 		 617 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  24.73 
 
 		 610 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  25.51 
 
 		 606 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  35.06 
 
 		 615 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  26.67 
 
 		 827 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  27.48 
 
 		 607 aa  54.7  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  24.38 
 
 		 601 aa  53.5  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.45 
 
 		 737 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  24.28 
 
 		 671 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  25.9 
 
 		 615 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  26.24 
 
 		 617 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  29.63 
 
 		 625 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  28.3 
 
 		 616 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  26.22 
 
 		 634 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  22.41 
 
 		 662 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  25.43 
 
 		 660 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  24.88 
 
 		 720 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  28.07 
 
 		 717 aa  44.3  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>