71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0342 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  100 
 
 		 550 aa  1110    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  67.88 
 
 		 563 aa  759    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  67.88 
 
 		 563 aa  759    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  68.8 
 
 		 551 aa  724    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  68.25 
 
 		 549 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  68.57 
 
 		 551 aa  748    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  45.31 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  29.57 
 
 		 559 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  29.14 
 
 		 574 aa  177  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  26.57 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  27.6 
 
 		 579 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  25.75 
 
 		 606 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  24.81 
 
 		 578 aa  100  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  25.4 
 
 		 527 aa  97.1  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  26.53 
 
 		 533 aa  96.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  28.66 
 
 		 554 aa  89  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  25.29 
 
 		 541 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  29.02 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  28.9 
 
 		 555 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  26.45 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  28.57 
 
 		 555 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  28.08 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  28.08 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  27.14 
 
 		 555 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  23.21 
 
 		 613 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  24.57 
 
 		 626 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  25.36 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  27.87 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  22.81 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  25.66 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  25.66 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  25.66 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  25.66 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  25.66 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  23.59 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  25.66 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  25.07 
 
 		 669 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  23.85 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  23.83 
 
 		 610 aa  68.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  26.2 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  23.95 
 
 		 625 aa  67  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  23.84 
 
 		 564 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  24.96 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  25.7 
 
 		 616 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  23.22 
 
 		 632 aa  60.5  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  34.06 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  21.39 
 
 		 588 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  22.63 
 
 		 619 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  23.54 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  23.81 
 
 		 612 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  21.81 
 
 		 616 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  31.75 
 
 		 662 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  24.18 
 
 		 615 aa  54.3  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  24.89 
 
 		 607 aa  53.9  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  25.42 
 
 		 634 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  29.92 
 
 		 695 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  26.67 
 
 		 617 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  30.71 
 
 		 673 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  30.48 
 
 		 388 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 737 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  21.39 
 
 		 619 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  23.16 
 
 		 631 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2836  NERD domain protein  23.21 
 
 		 197 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3287  NERD domain protein  23.21 
 
 		 197 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  26.19 
 
 		 714 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  23.67 
 
 		 703 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  23.67 
 
 		 703 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  24.51 
 
 		 617 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  22.01 
 
 		 607 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  24.54 
 
 		 827 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  26.02 
 
 		 696 aa  43.5  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>