71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1706 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  88.33 
 
 		 540 aa  967    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  100 
 
 		 541 aa  1080    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  43.8 
 
 		 533 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  39.3 
 
 		 544 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  37.68 
 
 		 557 aa  324  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  37.59 
 
 		 557 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  37.29 
 
 		 557 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  37.59 
 
 		 557 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  37.43 
 
 		 564 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  37.96 
 
 		 555 aa  319  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  36.51 
 
 		 555 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  36.8 
 
 		 555 aa  319  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  37.03 
 
 		 573 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  36.62 
 
 		 555 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  36.5 
 
 		 626 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  35.58 
 
 		 554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  35.58 
 
 		 554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  35.58 
 
 		 554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  35.58 
 
 		 554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  35.58 
 
 		 554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  35.58 
 
 		 554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  35.58 
 
 		 669 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  37.71 
 
 		 558 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  34.96 
 
 		 554 aa  247  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  26.4 
 
 		 559 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24.76 
 
 		 568 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  28.67 
 
 		 555 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  27.15 
 
 		 574 aa  87.4  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  26.06 
 
 		 551 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  26.99 
 
 		 549 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  27.85 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  26.83 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  26.83 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  24.81 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  24.21 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  28.45 
 
 		 632 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  24.87 
 
 		 616 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  25.11 
 
 		 579 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  25.64 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  24.52 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  27.94 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  20.38 
 
 		 827 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  24.93 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  31.97 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  27.34 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  27.65 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  33.78 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  26.75 
 
 		 610 aa  57  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.05 
 
 		 601 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  26.52 
 
 		 615 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.32 
 
 		 607 aa  54.7  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  27.6 
 
 		 625 aa  53.9  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  21.86 
 
 		 578 aa  53.9  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  30.63 
 
 		 616 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  25.16 
 
 		 527 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  26.99 
 
 		 617 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  24.69 
 
 		 671 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  26.75 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  22.5 
 
 		 588 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3287  NERD domain protein  23.6 
 
 		 197 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  31.21 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  21.99 
 
 		 710 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2836  NERD domain protein  23.6 
 
 		 197 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  26.01 
 
 		 660 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  22.99 
 
 		 662 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  26.22 
 
 		 634 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  29.87 
 
 		 562 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  24.88 
 
 		 720 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.77 
 
 		 737 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  26.96 
 
 		 673 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  25.85 
 
 		 719 aa  43.9  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>