50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0515 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 558 aa  1105    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  53.17 
 
 		 555 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  53.37 
 
 		 555 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  53.01 
 
 		 555 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  51.94 
 
 		 573 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  52.6 
 
 		 564 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  52.59 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  52.42 
 
 		 557 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  51.8 
 
 		 557 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  52.42 
 
 		 557 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  52.3 
 
 		 626 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  52.73 
 
 		 554 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  52.73 
 
 		 554 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  52.73 
 
 		 554 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  52.73 
 
 		 669 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  52.73 
 
 		 554 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  52.56 
 
 		 554 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  52.56 
 
 		 554 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  52.24 
 
 		 555 aa  535  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  45.55 
 
 		 544 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  37.89 
 
 		 541 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  37.38 
 
 		 540 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  35.07 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  36.92 
 
 		 533 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  26.71 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  22.11 
 
 		 568 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  27.03 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  25.21 
 
 		 601 aa  70.1  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  26.19 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  30.89 
 
 		 551 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  27.78 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  26.13 
 
 		 550 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  25 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  25 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  28.87 
 
 		 551 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  24.4 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  26.08 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  29.74 
 
 		 625 aa  55.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  22.22 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  24.8 
 
 		 612 aa  54.3  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  29.65 
 
 		 619 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  30.38 
 
 		 607 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  33.33 
 
 		 606 aa  50.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  27.55 
 
 		 617 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  26.51 
 
 		 527 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  29.45 
 
 		 615 aa  48.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  30.57 
 
 		 324 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  23.27 
 
 		 617 aa  47  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.77 
 
 		 607 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  23.91 
 
 		 632 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>