67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0422 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1117    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  38.97 
 
 		 555 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  39.13 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  37.68 
 
 		 557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  37.68 
 
 		 557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  38.28 
 
 		 555 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  37.81 
 
 		 557 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  38.38 
 
 		 555 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  36.06 
 
 		 573 aa  299  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  36.2 
 
 		 564 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  35.66 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  36.56 
 
 		 554 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  35.99 
 
 		 544 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  36.38 
 
 		 554 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  36.52 
 
 		 626 aa  293  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  36.67 
 
 		 669 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  36.38 
 
 		 554 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  36.38 
 
 		 554 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  36.38 
 
 		 554 aa  293  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  36.38 
 
 		 554 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  35.08 
 
 		 558 aa  266  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  35.7 
 
 		 540 aa  249  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  34.96 
 
 		 541 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  29.62 
 
 		 533 aa  174  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  27.18 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24.5 
 
 		 568 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  25.56 
 
 		 574 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  28.67 
 
 		 555 aa  87.8  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  28.12 
 
 		 550 aa  81.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  30.25 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  29.91 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  25.28 
 
 		 610 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  29.91 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  25.78 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  26.76 
 
 		 593 aa  77.4  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.03 
 
 		 601 aa  77  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  24.4 
 
 		 615 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  26.23 
 
 		 619 aa  73.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  28.26 
 
 		 551 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  24.04 
 
 		 578 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  25.2 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  24.28 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  28.15 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  29.41 
 
 		 613 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  23.12 
 
 		 606 aa  58.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  19.77 
 
 		 827 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  28.03 
 
 		 612 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  30.16 
 
 		 625 aa  56.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  32.37 
 
 		 615 aa  55.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  22.48 
 
 		 616 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  24.59 
 
 		 632 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.6 
 
 		 704 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.6 
 
 		 704 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 		 704 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  28.39 
 
 		 617 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  23.12 
 
 		 527 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  25.68 
 
 		 631 aa  47.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 705 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1045  UvrD/REP helicase  28.7 
 
 		 587 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52657  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  23.63 
 
 		 634 aa  47  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.73 
 
 		 607 aa  47  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  29.14 
 
 		 619 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  33.62 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  24.01 
 
 		 706 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  24.77 
 
 		 689 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  23.74 
 
 		 696 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  20.89 
 
 		 588 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>