32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2943 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  57.32 
 
 
662 aa  789    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  56.71 
 
 
662 aa  788    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  100 
 
 
660 aa  1357    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4009  putative ATP-dependent helicase  39.81 
 
 
677 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2003  putative ATP-dependent helicase  40.96 
 
 
662 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.148023  hitchhiker  0.00375343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  30.36 
 
 
720 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2231  hypothetical protein  28.06 
 
 
702 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0202187  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  27.24 
 
 
719 aa  98.2  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  28.15 
 
 
723 aa  91.3  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  25.5 
 
 
710 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  24.77 
 
 
824 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  24.15 
 
 
830 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  24.15 
 
 
830 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  24.26 
 
 
726 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  24.26 
 
 
726 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  21.93 
 
 
588 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2691  hypothetical protein  25.87 
 
 
382 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486273  normal  0.199519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  27.98 
 
 
619 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  27.01 
 
 
616 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  21.06 
 
 
625 aa  50.8  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  34.38 
 
 
759 aa  48.9  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  25.71 
 
 
690 aa  48.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  33.85 
 
 
752 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  27.59 
 
 
616 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  26.01 
 
 
541 aa  45.8  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  21.95 
 
 
568 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 
708 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  25.91 
 
 
632 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  25.43 
 
 
540 aa  44.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 
662 aa  44.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  41.86 
 
 
717 aa  44.3  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  23.96 
 
 
612 aa  43.9  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>