46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0738 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1308    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  54.2 
 
 		 617 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  49.13 
 
 		 617 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  24.29 
 
 		 827 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  24.13 
 
 		 634 aa  147  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  26.5 
 
 		 619 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  27.52 
 
 		 593 aa  101  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  25.05 
 
 		 601 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  24.72 
 
 		 593 aa  84  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  25.82 
 
 		 613 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  23.33 
 
 		 616 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.68 
 
 		 607 aa  80.5  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  28.87 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  24.2 
 
 		 612 aa  77  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0350  DNA helicase II related protein, putative  22.03 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00193946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  24.79 
 
 		 610 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0349  DNA helicase II related protein, putative  24.03 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.217591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  28.32 
 
 		 625 aa  71.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  24.16 
 
 		 619 aa  70.5  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  27.72 
 
 		 615 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  20.81 
 
 		 588 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  28.94 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  22.24 
 
 		 616 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  26.37 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  23.3 
 
 		 579 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24 
 
 		 568 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  24.54 
 
 		 574 aa  54.3  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  25.31 
 
 		 520 aa  53.5  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  24.24 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  28.1 
 
 		 719 aa  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  24.8 
 
 		 615 aa  48.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  22.25 
 
 		 549 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  25.68 
 
 		 554 aa  47.8  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  24.87 
 
 		 606 aa  47.4  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  22.11 
 
 		 550 aa  47.4  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  24.74 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  24.12 
 
 		 551 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  24.84 
 
 		 563 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  24.84 
 
 		 563 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  21.48 
 
 		 314 aa  44.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  22.44 
 
 		 544 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  35 
 
 		 737 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  33.33 
 
 		 717 aa  44.3  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  24.64 
 
 		 573 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  33.67 
 
 		 821 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 		 695 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>