More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25591 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  53.95 
 
 
781 aa  890    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  76.32 
 
 
805 aa  1276    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25591  UvrD/REP helicase  100 
 
 
802 aa  1630    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  56.38 
 
 
772 aa  922    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  87.64 
 
 
798 aa  1394    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  86.77 
 
 
796 aa  1379    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0306  ATP-dependent DNA helicase Rep  61.43 
 
 
802 aa  1028    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  64.38 
 
 
794 aa  1049    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  76.32 
 
 
805 aa  1276    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  57.92 
 
 
797 aa  934    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03281  UvrD/REP helicase  61.68 
 
 
802 aa  1024    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  54.98 
 
 
772 aa  905    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4232  ATP-dependent DNA helicase Rep  52.32 
 
 
781 aa  855    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491131  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  53.95 
 
 
781 aa  892    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03271  UvrD/REP helicase  60.93 
 
 
802 aa  1024    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03301  UvrD/REP helicase  75.41 
 
 
809 aa  1249    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.479147  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  55.35 
 
 
776 aa  924    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03371  UvrD/REP helicase  61.95 
 
 
802 aa  1037    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.14 
 
 
729 aa  558  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.86 
 
 
785 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.71 
 
 
754 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.12 
 
 
737 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.7 
 
 
730 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.12 
 
 
741 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 
755 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.41 
 
 
732 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.14 
 
 
773 aa  542  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  41.05 
 
 
762 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.71 
 
 
757 aa  537  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.18 
 
 
786 aa  535  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  42.16 
 
 
768 aa  534  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  41.52 
 
 
707 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.13 
 
 
694 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.95 
 
 
711 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.14 
 
 
851 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.1 
 
 
715 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.27 
 
 
747 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.27 
 
 
831 aa  525  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.65 
 
 
838 aa  525  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.05 
 
 
768 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  38.84 
 
 
757 aa  524  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.02 
 
 
730 aa  521  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.56 
 
 
751 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  38.56 
 
 
753 aa  521  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.49 
 
 
765 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.56 
 
 
751 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.95 
 
 
742 aa  521  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.56 
 
 
747 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.02 
 
 
730 aa  521  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  40.85 
 
 
736 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.73 
 
 
858 aa  519  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.39 
 
 
753 aa  522  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  38.61 
 
 
731 aa  519  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.02 
 
 
763 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.69 
 
 
741 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  41.24 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.02 
 
 
729 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  38.39 
 
 
751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.39 
 
 
751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.12 
 
 
718 aa  519  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.16 
 
 
751 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.16 
 
 
751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.08 
 
 
795 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.22 
 
 
781 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.18 
 
 
753 aa  515  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.72 
 
 
858 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.95 
 
 
806 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.03 
 
 
725 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  39.98 
 
 
737 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  41.14 
 
 
746 aa  512  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.71 
 
 
833 aa  506  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.78 
 
 
747 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  40.62 
 
 
738 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  36.87 
 
 
807 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.46 
 
 
781 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.83 
 
 
738 aa  502  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.88 
 
 
794 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  39.93 
 
 
738 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.54 
 
 
756 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.7 
 
 
857 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 
766 aa  500  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.27 
 
 
837 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.07 
 
 
829 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  39.75 
 
 
744 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.95 
 
 
762 aa  499  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.27 
 
 
759 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  41.37 
 
 
678 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.14 
 
 
932 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.67 
 
 
896 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.42 
 
 
830 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  39.15 
 
 
762 aa  496  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.93 
 
 
797 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  40.52 
 
 
742 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 
817 aa  491  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  39.95 
 
 
771 aa  488  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.3 
 
 
775 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  43.17 
 
 
705 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.86 
 
 
780 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.03 
 
 
758 aa  484  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  38.96 
 
 
765 aa  479  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>