85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0078 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  100 
 
 
456 aa  918  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  79.52 
 
 
456 aa  719  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  65.86 
 
 
454 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  59.96 
 
 
464 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  56.36 
 
 
454 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  53.46 
 
 
433 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  46.78 
 
 
459 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  62.28 
 
 
283 aa  341  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  44.2 
 
 
492 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  42.67 
 
 
467 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  39.61 
 
 
470 aa  306  5e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  40.47 
 
 
477 aa  299  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  51.82 
 
 
226 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  67.26 
 
 
114 aa  157  5e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  54.95 
 
 
106 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  51.72 
 
 
89 aa  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  51.11 
 
 
104 aa  82.8  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  31.34 
 
 
409 aa  69.3  1e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.93 
 
 
385 aa  62.4  1e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  53.33 
 
 
66 aa  62  2e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.37 
 
 
392 aa  61.2  4e-08  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.14 
 
 
300 aa  59.7  1e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  25.9 
 
 
407 aa  57.8  4e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  24.25 
 
 
375 aa  56.2  1e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.35 
 
 
379 aa  55.8  2e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.2 
 
 
378 aa  55.8  2e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.27 
 
 
477 aa  55.5  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.82 
 
 
431 aa  55.5  2e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.42 
 
 
370 aa  54.7  4e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.16 
 
 
390 aa  54.3  5e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.81 
 
 
363 aa  54.3  5e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.03 
 
 
403 aa  53.5  8e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  31.11 
 
 
354 aa  53.5  8e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  33.33 
 
 
306 aa  52.8  1e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  20.49 
 
 
392 aa  52.8  1e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.14 
 
 
414 aa  52.4  2e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.65 
 
 
376 aa  52.4  2e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2112  phage integrase family site specific recombinase  24.22 
 
 
494 aa  51.2  4e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.72 
 
 
391 aa  51.2  4e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  23.6 
 
 
297 aa  50.1  8e-05  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.03109e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  27.78 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  29.02 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  21.97 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  29.02 
 
 
471 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  23.85 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  27.66 
 
 
452 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.86 
 
 
368 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.01 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.9 
 
 
463 aa  47  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  24.38 
 
 
356 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.91 
 
 
378 aa  46.6  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  26.64 
 
 
338 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  22.77 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.5 
 
 
386 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  26.47 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.07497e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  33.68 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.96 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  32.05 
 
 
357 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.33 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.92 
 
 
389 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  26.03 
 
 
336 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  31.53 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  36.21 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  24.25 
 
 
329 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  23.8 
 
 
387 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.86 
 
 
383 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.58 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  27.14 
 
 
344 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1679  integrase  23.19 
 
 
372 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  27.14 
 
 
364 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  27.14 
 
 
364 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  26.46 
 
 
300 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.58 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.65 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  25.82 
 
 
288 aa  44.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0404  integrase family protein  24.79 
 
 
320 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  8.63146e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  27.44 
 
 
334 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  27.33 
 
 
469 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.51 
 
 
310 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  27.72 
 
 
362 aa  43.9  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  23.51 
 
 
302 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  20.6 
 
 
388 aa  43.9  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.82 
 
 
435 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.38 
 
 
356 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  30.65 
 
 
433 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>